15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1193 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1193  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  289  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0476503  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1788  hypothetical protein  57.66 
 
 
142 aa  167  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5576  protein of unknown function DUF1123  58.96 
 
 
152 aa  151  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4661  hypothetical protein  58.96 
 
 
144 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1194  hypothetical protein  50.74 
 
 
143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.66079  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1789  hypothetical protein  51.13 
 
 
144 aa  133  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4577  hypothetical protein  50.39 
 
 
138 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0645  hypothetical protein  47.1 
 
 
140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368313  normal  0.208528 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03979  conserved hypothetical protein  43.88 
 
 
145 aa  121  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140824  normal  0.587359 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03510  conserved hypothetical protein  47.2 
 
 
507 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  28.24 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  32.95 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  32.43 
 
 
139 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.259445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  32.35 
 
 
138 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  26.85 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>