22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1176 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  273  5e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2267  hypothetical protein  40.46 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  39.69 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2544  hypothetical protein  40.46 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120764  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  42.19 
 
 
138 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  37.98 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0436  protein of unknown function DUF1123  40.62 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3191  hypothetical protein  34.35 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1922  hypothetical protein  36.09 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1327  protein of unknown function DUF1123  33.58 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  29.41 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.259445 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1789  hypothetical protein  29.03 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03979  conserved hypothetical protein  37.8 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140824  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1193  hypothetical protein  34.85 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0476503  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4577  hypothetical protein  25 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4661  hypothetical protein  31.58 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1788  hypothetical protein  25.76 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5576  protein of unknown function DUF1123  29.89 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0645  hypothetical protein  26.03 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368313  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1194  hypothetical protein  26.67 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.66079  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4276  hypothetical protein  30.63 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03510  conserved hypothetical protein  29.51 
 
 
507 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>