21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1922 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1922  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  292  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1327  protein of unknown function DUF1123  46.81 
 
 
129 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2544  hypothetical protein  47.52 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2267  hypothetical protein  45.32 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3191  hypothetical protein  42.86 
 
 
140 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  36.09 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3065  hypothetical protein  34.53 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100645  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  30.71 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0436  protein of unknown function DUF1123  32.09 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3612  hypothetical protein  33.09 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0530007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0449  hypothetical protein  31.94 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533472  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4577  hypothetical protein  25.69 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  25 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0645  hypothetical protein  26.15 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368313  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1788  hypothetical protein  26.95 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03510  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 
507 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  27.5 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.259445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4276  hypothetical protein  27.68 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01837  hypothetical protein  29.41 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.185242  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03979  conserved hypothetical protein  24.22 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140824  normal  0.587359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>