12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3065 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3065  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100645  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3191  hypothetical protein  58.57 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2267  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2544  hypothetical protein  44.76 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120764  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3612  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1327  protein of unknown function DUF1123  39.23 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1922  hypothetical protein  34.53 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0449  hypothetical protein  41.54 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533472  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0436  protein of unknown function DUF1123  34.74 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  38.89 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  36.62 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  25.93 
 
 		 138 aa  40.8  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>