14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3191 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3191  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  276  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2267  hypothetical protein  75 
 
 		 140 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2544  hypothetical protein  66.91 
 
 		 139 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3065  hypothetical protein  58.57 
 
 		 123 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100645  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3612  hypothetical protein  51.43 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1327  protein of unknown function DUF1123  40.58 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1922  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  104  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  37.86 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  34.35 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0436  protein of unknown function DUF1123  36.43 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  38.76 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0449  hypothetical protein  33.8 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533472  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  29.09 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.259445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>