16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2267 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2267  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3191  hypothetical protein  75 
 
 		 140 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2544  hypothetical protein  69.78 
 
 		 139 aa  197  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3065  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100645  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3612  hypothetical protein  51.43 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1922  hypothetical protein  45.32 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1327  protein of unknown function DUF1123  44.93 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  40.46 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0436  protein of unknown function DUF1123  38.24 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  38.3 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  31.82 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0449  hypothetical protein  35.92 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533472  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  29.91 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.259445 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01837  hypothetical protein  35.21 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.185242  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4276  hypothetical protein  29.84 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>