17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0436 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0436  protein of unknown function DUF1123  100 
 
 
138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  89.13 
 
 
138 aa  259  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  71.01 
 
 
138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2267  hypothetical protein  38.24 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  40.62 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3191  hypothetical protein  36.43 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2544  hypothetical protein  32.59 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120764  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1327  protein of unknown function DUF1123  32.31 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  30.15 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1922  hypothetical protein  32.09 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01837  hypothetical protein  34.82 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.185242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  32.63 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.259445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3065  hypothetical protein  34.74 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100645  normal  0.0433353 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03979  conserved hypothetical protein  34.74 
 
 
145 aa  50.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140824  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3612  hypothetical protein  32.97 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0530007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1194  hypothetical protein  27.78 
 
 
143 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.66079  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1789  hypothetical protein  28.87 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>