17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1789 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1789  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  290  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1194  hypothetical protein  58.04 
 
 
143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.66079  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1193  hypothetical protein  54.78 
 
 
144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0476503  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1788  hypothetical protein  47.83 
 
 
142 aa  121  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4661  hypothetical protein  45.59 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5576  protein of unknown function DUF1123  44.93 
 
 
152 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03979  conserved hypothetical protein  40.44 
 
 
145 aa  102  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140824  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4577  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  99.4  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0645  hypothetical protein  37.32 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368313  normal  0.208528 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03510  conserved hypothetical protein  40.32 
 
 
507 aa  91.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  32.31 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  29.03 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  34.02 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  32.88 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.259445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  29.9 
 
 
138 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1327  protein of unknown function DUF1123  29.7 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0436  protein of unknown function DUF1123  28.87 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>