17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0645 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0645  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  286  7e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368313  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4577  hypothetical protein  45.99 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4661  hypothetical protein  50.35 
 
 
144 aa  130  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5576  protein of unknown function DUF1123  53.6 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1193  hypothetical protein  49.17 
 
 
144 aa  116  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0476503  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1788  hypothetical protein  48.12 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03979  conserved hypothetical protein  46.04 
 
 
145 aa  114  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140824  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1194  hypothetical protein  39.86 
 
 
143 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.66079  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03510  conserved hypothetical protein  43.9 
 
 
507 aa  102  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1789  hypothetical protein  37.32 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  31.36 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1327  protein of unknown function DUF1123  27.66 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  26.03 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1922  hypothetical protein  26.15 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2544  hypothetical protein  25 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  27.64 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.259445 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01837  hypothetical protein  24.58 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.185242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>