14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4661 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4661  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  288  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5576  protein of unknown function DUF1123  58.99 
 
 		 152 aa  170  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1788  hypothetical protein  51.8 
 
 		 142 aa  140  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1193  hypothetical protein  60.87 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0476503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0645  hypothetical protein  50.35 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368313  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4577  hypothetical protein  45.99 
 
 		 138 aa  123  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03979  conserved hypothetical protein  47.45 
 
 		 145 aa  120  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140824  normal  0.587359 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03510  conserved hypothetical protein  48.82 
 
 		 507 aa  117  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1789  hypothetical protein  45.59 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1194  hypothetical protein  44.76 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.66079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  30.66 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  31.58 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  32.67 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  28.93 
 
 		 139 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.259445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>