14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5576 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5576  protein of unknown function DUF1123  100 
 
 
152 aa  300  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4661  hypothetical protein  58.99 
 
 
144 aa  170  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1193  hypothetical protein  60.5 
 
 
144 aa  142  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0476503  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4577  hypothetical protein  55.04 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1788  hypothetical protein  51.8 
 
 
142 aa  137  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0645  hypothetical protein  53.6 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368313  normal  0.208528 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03510  conserved hypothetical protein  50 
 
 
507 aa  122  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03979  conserved hypothetical protein  49.58 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140824  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1789  hypothetical protein  44.93 
 
 
144 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1194  hypothetical protein  43.17 
 
 
143 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.66079  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  28.45 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  29.89 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  32.17 
 
 
138 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01837  hypothetical protein  24.79 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.185242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>