23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0479 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  100 
 
 
138 aa  279  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0436  protein of unknown function DUF1123  89.13 
 
 
138 aa  259  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  69.57 
 
 
138 aa  209  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  42.19 
 
 
138 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2267  hypothetical protein  38.3 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3191  hypothetical protein  37.86 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2544  hypothetical protein  34.81 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120764  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1327  protein of unknown function DUF1123  30.94 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  32.56 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1922  hypothetical protein  30.71 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01837  hypothetical protein  33.04 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.185242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  33.68 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.259445 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03979  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 
145 aa  51.2  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140824  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1194  hypothetical protein  31.19 
 
 
143 aa  50.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.66079  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3065  hypothetical protein  38.89 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100645  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4661  hypothetical protein  32.67 
 
 
144 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3612  hypothetical protein  34.38 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0530007 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03510  conserved hypothetical protein  43.33 
 
 
507 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5576  protein of unknown function DUF1123  32.17 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4577  hypothetical protein  31.65 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1193  hypothetical protein  31.82 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0476503  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1789  hypothetical protein  29.9 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1788  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>