19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1327 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1327  protein of unknown function DUF1123  100 
 
 		 129 aa  253  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1922  hypothetical protein  46.81 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2544  hypothetical protein  47.83 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2267  hypothetical protein  44.93 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3191  hypothetical protein  40.58 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3065  hypothetical protein  39.23 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100645  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3612  hypothetical protein  38.1 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0436  protein of unknown function DUF1123  32.31 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  30.94 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  34.38 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0449  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533472  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  33.58 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  28.36 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0645  hypothetical protein  27.66 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368313  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  32.47 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.259445 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03979  conserved hypothetical protein  30.71 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140824  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01837  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.185242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1789  hypothetical protein  29.7 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1788  hypothetical protein  24.82 
 
 		 142 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>