16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2544 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2544  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  273  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120764  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2267  hypothetical protein  69.78 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3191  hypothetical protein  66.91 
 
 		 140 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1327  protein of unknown function DUF1123  47.83 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1922  hypothetical protein  47.52 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3612  hypothetical protein  47.48 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3065  hypothetical protein  44.76 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100645  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  40.46 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  34.81 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0436  protein of unknown function DUF1123  32.59 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  33.59 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  34.35 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01837  hypothetical protein  32.65 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.185242  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0449  hypothetical protein  34.72 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533472  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  40.98 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.259445 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0645  hypothetical protein  25 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368313  normal  0.208528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>