17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1788 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1788  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1193  hypothetical protein  58.33 
 
 
144 aa  153  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0476503  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4661  hypothetical protein  51.8 
 
 
144 aa  140  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5576  protein of unknown function DUF1123  51.8 
 
 
152 aa  137  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4577  hypothetical protein  49.6 
 
 
138 aa  127  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1789  hypothetical protein  47.83 
 
 
144 aa  121  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03979  conserved hypothetical protein  44.37 
 
 
145 aa  120  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140824  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0645  hypothetical protein  48.12 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368313  normal  0.208528 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03510  conserved hypothetical protein  43.18 
 
 
507 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1194  hypothetical protein  43.94 
 
 
143 aa  110  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.66079  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  28.46 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  25.76 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1922  hypothetical protein  26.95 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  26.02 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.259445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  25 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  31.25 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1327  protein of unknown function DUF1123  24.82 
 
 
129 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>