More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22690 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_22690  cysteine synthase  100 
 
 		 321 aa  651    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.794024  normal  0.909428 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2304  cysteine synthase  50.65 
 
 		 310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  47.54 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  47.54 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  47.83 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  46.45 
 
 		 312 aa  269  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  46.45 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  45.54 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  44.98 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  47.25 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  44.16 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  46.2 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  46.43 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  46.91 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  45.31 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  46.93 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  43.18 
 
 		 304 aa  249  7e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  45.82 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  43.67 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  42.07 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  45.48 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  45.45 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  45.93 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  45.42 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  44.84 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  46.41 
 
 		 306 aa  242  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  42.26 
 
 		 315 aa  242  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  46.75 
 
 		 305 aa  241  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  47.08 
 
 		 309 aa  241  9e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  45.57 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  45.63 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  44.77 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  48.18 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2361  cysteine synthase A  44.34 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  44.11 
 
 		 302 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  43.32 
 
 		 305 aa  239  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2362  cysteine synthase  44.3 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1922  cysteine synthase A  44.34 
 
 		 307 aa  238  9e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  45.28 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  44.95 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  46.53 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  44.07 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  45.57 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  44.66 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  45.25 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  45.57 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  45.57 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  46.2 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  46.2 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  45.25 
 
 		 305 aa  235  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  46.2 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  46.2 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  45.25 
 
 		 305 aa  235  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  44.92 
 
 		 305 aa  235  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  46.2 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  44.92 
 
 		 305 aa  235  9e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  44.3 
 
 		 310 aa  235  9e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  45.25 
 
 		 305 aa  235  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  45.25 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  41.5 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  46.2 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  43.05 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  46.2 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  46.2 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  44.19 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  41.18 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  43.87 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  45.34 
 
 		 310 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  46.25 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  45.87 
 
 		 307 aa  231  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  46.91 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  44.3 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  44.01 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  45.54 
 
 		 307 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  43.93 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  39.81 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  44.74 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  43.23 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  40.39 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  42.9 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  43.37 
 
 		 298 aa  228  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  43.49 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  38.96 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  43.69 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  45.87 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  40.32 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  44.52 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  43.46 
 
 		 307 aa  225  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  45.54 
 
 		 308 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  44.66 
 
 		 308 aa  225  9e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  43.55 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  45.83 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  42.9 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  41.37 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  44.87 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  44.37 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  43.23 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  42.26 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  41.88 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  45.1 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>