116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01650 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01650  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  332  1e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15040  hypothetical protein  99.4 
 
 
167 aa  332  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215047  normal  0.865118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03240  hypothetical protein  59.76 
 
 
177 aa  191  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311324  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2914  transposase and inactivated derivative  50.92 
 
 
167 aa  154  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1126  transposase and inactivated derivative  50.92 
 
 
167 aa  154  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00000113867 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0404  hypothetical protein  52.94 
 
 
165 aa  148  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00316236  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14510  Transposase  50.3 
 
 
171 aa  141  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.294873 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05870  hypothetical protein  47.9 
 
 
171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.786526  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0318  transposase  46.88 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.199253  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04840  hypothetical protein  47.44 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0242867  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  37.42 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  37.42 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  37.42 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  37.42 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  37.42 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.54 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.54 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.54 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.54 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.54 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  30.3 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  30.3 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  30.3 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  30.3 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  30.3 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  30.3 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  33.54 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  33.54 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  33.54 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.76 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.76 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.76 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.76 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.76 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.76 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.76 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  36.64 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0308  transposase, orfA ISRSO11-related  37.23 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3661  transposase  37.23 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  29.49 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  33.94 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  33.94 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  33.94 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  33.94 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  33.94 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  33.94 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  33.94 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  36.5 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3619  transposase  35.92 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0336979  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  34.16 
 
 
214 aa  62.4  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  29.49 
 
 
172 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  29.49 
 
 
172 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  29.48 
 
 
177 aa  61.6  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  29.48 
 
 
177 aa  61.6  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  30.43 
 
 
173 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  30.43 
 
 
173 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  29.81 
 
 
173 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3341  transposase for IS150  34.31 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  29.01 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  29.01 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3592  transposase  33.58 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152849 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  31.74 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0973  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0982549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2946  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863972  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3207  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1056  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  54.7  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.649602  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1092  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  54.7  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1363  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  54.7  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0632005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1479  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  54.7  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.113343 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0853  transposase  27.38 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2416  transposase  27.38 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  28.57 
 
 
173 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  28.57 
 
 
173 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  28.57 
 
 
173 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0274  ISPsy9, transposase OrfA  33.33 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0593  ISPsy9, transposase OrfA  33.33 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1177  ISPsy9, transposase OrfA  33.33 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4617  ISPsy9, transposase OrfA  33.33 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765931  normal  0.589726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4679  ISPsy9, transposase OrfA  33.33 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0661  transposase  30.49 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.202931  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0881  transposase  30.49 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.77737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1034  transposase  30.49 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.167204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1084  transposase  30.49 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143058  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1669  transposase  30.49 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  28.57 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0195  transposase  33.08 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5019  ISPsy9, transposase OrfA  33.33 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1360  transposase  29.45 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.452785  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0415  transposase  28.22 
 
 
185 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0145159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1127  IS3 family transposase OrfA  26.25 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00102571  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0057  IS3 family transposase OrfA  26.25 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0110  IS3-family transposase, OrfA  26.25 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0382548  hitchhiker  0.00000476368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1198  IS3-family transposase, OrfA  26.06 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0073  putative ISRSO11-transposase orfA protein  28.82 
 
 
175 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2608  hypothetical protein  23.85 
 
 
223 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0514  transposase  32.67 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1313  transposase  32.67 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000204726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2023  transposase  32.67 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>