150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0813 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  68 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  68 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  68 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  68 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  68 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  68 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  68 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  71.07 
 
 		 174 aa  228  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  71.07 
 
 		 174 aa  228  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  71.07 
 
 		 174 aa  228  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  71.07 
 
 		 174 aa  228  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  71.07 
 
 		 174 aa  228  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  62.5 
 
 		 177 aa  214  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  62.5 
 
 		 177 aa  214  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  62.5 
 
 		 177 aa  214  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  56.44 
 
 		 175 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  65.25 
 
 		 142 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5019  ISPsy9, transposase OrfA  51.69 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0274  ISPsy9, transposase OrfA  51.12 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0593  ISPsy9, transposase OrfA  51.12 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1177  ISPsy9, transposase OrfA  51.12 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4617  ISPsy9, transposase OrfA  51.12 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765931  normal  0.589726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4679  ISPsy9, transposase OrfA  51.12 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  50.86 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  50.29 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  39.89 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  39.89 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0973  transposase IS3/IS911 family protein  41.95 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0982549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3207  transposase IS3/IS911 family protein  41.95 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2946  transposase IS3/IS911 family protein  41.95 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863972  normal  0.226837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  42.2 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  42.2 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  42.2 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1976  ISPsy8, transposase OrfA  41.95 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2653  ISPsy8, transposase OrfA  41.95 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3316  ISPsy8, transposase OrfA  41.95 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.395591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4859  ISPsy8, transposase OrfA  41.95 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  42.2 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0123  ISPsy8, transposase OrfA  39.66 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0449  ISPsy8, transposase OrfA  39.66 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0515  ISPsy8, transposase OrfA  39.66 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5065  ISPsy8, transposase OrfA  39.66 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5508  ISPsy8, transposase OrfA  39.66 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2725  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  68.83 
 
 		 91 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0073  putative ISRSO11-transposase orfA protein  40 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  33.72 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  33.72 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  33.72 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  33.72 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  33.72 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  33.72 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  36.05 
 
 		 172 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  36.05 
 
 		 172 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  32.76 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  32.76 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  32.76 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  32.76 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  34.3 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0318  transposase  40.24 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.199253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1127  IS3 family transposase OrfA  35.47 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00102571  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0057  IS3 family transposase OrfA  35.47 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0110  IS3-family transposase, OrfA  35.47 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0382548  hitchhiker  0.00000476368 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  33.72 
 
 		 172 aa  94.4  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  33.72 
 
 		 172 aa  94.4  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1198  IS3-family transposase, OrfA  35.47 
 
 		 206 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  34.88 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  34.88 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  34.88 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  34.88 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  34.88 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  34.88 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  34.88 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  34.88 
 
 		 214 aa  89  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0308  transposase, orfA ISRSO11-related  28.98 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3661  transposase  28.98 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3619  transposase  27.93 
 
 		 172 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0336979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1056  hypothetical protein  30.54 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.649602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1092  hypothetical protein  30.54 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1363  hypothetical protein  30.54 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1479  hypothetical protein  30.54 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113343 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2726  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00543  IS150 hypothetical protein  31.74 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.182774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00619  IS150 hypothetical protein  31.74 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03408  IS150 hypothetical protein  31.74 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04282  IS150 hypothetical protein  31.74 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04285  IS150 hypothetical protein  31.74 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0154  IS103 orf  31.74 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1073  IS150 transposase orfA  31.74 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0858431 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03359  hypothetical protein  31.74 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03578  hypothetical protein  31.74 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00608  hypothetical protein  31.74 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00532  hypothetical protein  31.74 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02651  hypothetical protein  31.74 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3879  IS150 transposase orfA  31.74 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3759  IS150, transposase orfA  31.74 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>