119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2266 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



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Replicon accession
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% identity
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  99.3 
 
 		 177 aa  289  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  100 
 
 		 142 aa  289  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  99.3 
 
 		 177 aa  289  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  99.3 
 
 		 177 aa  289  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  58.16 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  58.16 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  58.16 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  58.16 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  58.16 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  58.16 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  58.16 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  64 
 
 		 174 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  64 
 
 		 174 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  64 
 
 		 174 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  64 
 
 		 174 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  64 
 
 		 174 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  56 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  56 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  56 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  56 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  56 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  56.92 
 
 		 175 aa  140  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 178 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 178 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5019  ISPsy9, transposase OrfA  45.14 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0274  ISPsy9, transposase OrfA  44.06 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0593  ISPsy9, transposase OrfA  44.06 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1177  ISPsy9, transposase OrfA  44.06 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4617  ISPsy9, transposase OrfA  44.06 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765931  normal  0.589726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4679  ISPsy9, transposase OrfA  44.06 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  40.43 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  40.43 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  40.43 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  40.43 
 
 		 173 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  37.59 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  37.59 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  35.46 
 
 		 173 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  35.46 
 
 		 173 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  35.46 
 
 		 173 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  35.46 
 
 		 173 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0073  putative ISRSO11-transposase orfA protein  34.29 
 
 		 175 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0973  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 		 173 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0982549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2946  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 		 173 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863972  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3207  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 		 173 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  34.53 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  34.53 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  34.53 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  34.53 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  34.53 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  34.53 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0195  transposase  31.91 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  35.71 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0308  transposase, orfA ISRSO11-related  34.97 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3661  transposase  34.97 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  35 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  35 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1056  hypothetical protein  34.72 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.649602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1092  hypothetical protein  34.72 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1363  hypothetical protein  34.72 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1479  hypothetical protein  34.72 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113343 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3619  transposase  33.57 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0336979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  37.21 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  37.21 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  37.21 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  37.21 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  37.21 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  37.21 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  37.21 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  37.21 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0123  ISPsy8, transposase OrfA  33.1 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0449  ISPsy8, transposase OrfA  33.1 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0515  ISPsy8, transposase OrfA  33.1 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5065  ISPsy8, transposase OrfA  33.1 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5508  ISPsy8, transposase OrfA  33.1 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1976  ISPsy8, transposase OrfA  33.57 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2653  ISPsy8, transposase OrfA  33.57 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3316  ISPsy8, transposase OrfA  33.57 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.395591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4859  ISPsy8, transposase OrfA  33.57 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3341  transposase for IS150  33.08 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  34.06 
 
 		 172 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  34.06 
 
 		 172 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3592  transposase  32.33 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2726  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1127  IS3 family transposase OrfA  33.81 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00102571  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0057  IS3 family transposase OrfA  33.81 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0110  IS3-family transposase, OrfA  33.81 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0382548  hitchhiker  0.00000476368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1198  IS3-family transposase, OrfA  33.81 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2725  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  61.9 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15040  hypothetical protein  36.64 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215047  normal  0.865118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01650  hypothetical protein  36.64 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3879  IS150 transposase orfA  32.31 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591141  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00543  IS150 hypothetical protein  32.31 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.182774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00619  IS150 hypothetical protein  32.31 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03408  IS150 hypothetical protein  32.31 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04282  IS150 hypothetical protein  32.31 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04285  IS150 hypothetical protein  32.31 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0154  IS103 orf  32.31 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_00532  hypothetical protein  32.31 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_00608  hypothetical protein  32.31 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1073  IS150 transposase orfA  32.31 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0858431 
 
 
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