137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5019 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5019  ISPsy9, transposase OrfA  100 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0274  ISPsy9, transposase OrfA  98.32 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0593  ISPsy9, transposase OrfA  98.32 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1177  ISPsy9, transposase OrfA  98.32 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4617  ISPsy9, transposase OrfA  98.32 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765931  normal  0.589726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4679  ISPsy9, transposase OrfA  98.32 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  53.63 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  53.07 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  47.53 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  47.53 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  47.53 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  47.53 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  47.53 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  44.38 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  44.38 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  44.38 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  44.38 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  44.38 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  44.38 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  44.38 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  42.22 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  42.22 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  42.22 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1976  ISPsy8, transposase OrfA  42.69 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2653  ISPsy8, transposase OrfA  42.69 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3316  ISPsy8, transposase OrfA  42.69 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.395591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4859  ISPsy8, transposase OrfA  42.69 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  39.16 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  38.67 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  38.67 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  38.67 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  38.67 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0123  ISPsy8, transposase OrfA  40.12 
 
 		 171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0449  ISPsy8, transposase OrfA  40.12 
 
 		 171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0515  ISPsy8, transposase OrfA  40.12 
 
 		 171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5065  ISPsy8, transposase OrfA  40.12 
 
 		 171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_5508  ISPsy8, transposase OrfA  40.12 
 
 		 171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  35.36 
 
 		 177 aa  110  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  35.36 
 
 		 177 aa  110  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2946  transposase IS3/IS911 family protein  40.56 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863972  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3207  transposase IS3/IS911 family protein  40.56 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0973  transposase IS3/IS911 family protein  40.56 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0982549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  45.14 
 
 		 142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0073  putative ISRSO11-transposase orfA protein  38.76 
 
 		 175 aa  94  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  33.15 
 
 		 173 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  33.15 
 
 		 173 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  33.15 
 
 		 173 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  32.58 
 
 		 173 aa  87.4  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0308  transposase, orfA ISRSO11-related  32.43 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3661  transposase  32.43 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3619  transposase  33.71 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0336979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  33.71 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  33.71 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  33.71 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  33.71 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  33.71 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  33.71 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  33.71 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  33.71 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0195  transposase  30.73 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3341  transposase for IS150  30.73 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3592  transposase  30.17 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152849 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1127  IS3 family transposase OrfA  31.55 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00102571  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0057  IS3 family transposase OrfA  31.55 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0110  IS3-family transposase, OrfA  31.55 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0382548  hitchhiker  0.00000476368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1198  IS3-family transposase, OrfA  31.55 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010559  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  36.31 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  36.31 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  31.55 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  31.55 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  31.55 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  31.55 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  31.55 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  31.55 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1056  hypothetical protein  29.67 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.649602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1092  hypothetical protein  29.67 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1363  hypothetical protein  29.67 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1479  hypothetical protein  29.67 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113343 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  31.58 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  30.46 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  30.46 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00543  IS150 hypothetical protein  28.82 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.182774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00619  IS150 hypothetical protein  28.82 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03408  IS150 hypothetical protein  28.82 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04282  IS150 hypothetical protein  28.82 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04285  IS150 hypothetical protein  28.82 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0154  IS103 orf  28.82 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00532  hypothetical protein  28.82 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02651  hypothetical protein  28.82 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03359  hypothetical protein  28.82 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3759  IS150, transposase orfA  28.82 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2725  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  41.03 
 
 		 91 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00608  hypothetical protein  28.82 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1073  IS150 transposase orfA  28.82 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0858431 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3879  IS150 transposase orfA  28.82 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591141  normal  1 
 
 
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