137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0593 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0274  ISPsy9, transposase OrfA  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0593  ISPsy9, transposase OrfA  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1177  ISPsy9, transposase OrfA  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4617  ISPsy9, transposase OrfA  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765931  normal  0.589726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4679  ISPsy9, transposase OrfA  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5019  ISPsy9, transposase OrfA  98.32 
 
 
179 aa  362  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  53.63 
 
 
178 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  53.07 
 
 
178 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  49.38 
 
 
174 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  49.38 
 
 
174 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  49.38 
 
 
174 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  49.38 
 
 
174 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  49.38 
 
 
174 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  47.53 
 
 
174 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  47.53 
 
 
174 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  47.53 
 
 
174 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  47.53 
 
 
174 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  47.53 
 
 
174 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  43.82 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  43.82 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  43.82 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  43.82 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  43.82 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  43.82 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  43.82 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  41.34 
 
 
177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  41.34 
 
 
177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  41.34 
 
 
177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  39.23 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  39.23 
 
 
173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  39.23 
 
 
173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  39.23 
 
 
173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  39.76 
 
 
175 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1976  ISPsy8, transposase OrfA  41.04 
 
 
171 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2653  ISPsy8, transposase OrfA  41.04 
 
 
171 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3316  ISPsy8, transposase OrfA  41.04 
 
 
171 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.395591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4859  ISPsy8, transposase OrfA  41.04 
 
 
171 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0123  ISPsy8, transposase OrfA  40.7 
 
 
171 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0449  ISPsy8, transposase OrfA  40.7 
 
 
171 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0515  ISPsy8, transposase OrfA  40.7 
 
 
171 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5065  ISPsy8, transposase OrfA  40.7 
 
 
171 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5508  ISPsy8, transposase OrfA  40.7 
 
 
171 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3207  transposase IS3/IS911 family protein  41.11 
 
 
173 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2946  transposase IS3/IS911 family protein  41.11 
 
 
173 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863972  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0973  transposase IS3/IS911 family protein  41.11 
 
 
173 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0982549 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  35.36 
 
 
177 aa  111  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  35.36 
 
 
177 aa  111  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  44.06 
 
 
142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0073  putative ISRSO11-transposase orfA protein  39.23 
 
 
175 aa  95.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0308  transposase, orfA ISRSO11-related  32.97 
 
 
172 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3661  transposase  32.97 
 
 
172 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  32.04 
 
 
173 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  32.04 
 
 
173 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  32.04 
 
 
173 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  32.04 
 
 
173 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3619  transposase  34.27 
 
 
172 aa  87.4  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0336979  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  34.64 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  34.64 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  34.64 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  34.64 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  34.64 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  34.64 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  34.64 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  34.64 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0195  transposase  30.73 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3341  transposase for IS150  31.76 
 
 
165 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3592  transposase  31.18 
 
 
165 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152849 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1127  IS3 family transposase OrfA  31.55 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00102571  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0057  IS3 family transposase OrfA  31.55 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0110  IS3-family transposase, OrfA  31.55 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0382548  hitchhiker  0.00000476368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1198  IS3-family transposase, OrfA  31.55 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010559  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  35.75 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  35.75 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  31.55 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  31.55 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  31.55 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  31.55 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  31.55 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  31.55 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1056  hypothetical protein  30.22 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.649602  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1092  hypothetical protein  30.22 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1363  hypothetical protein  30.22 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0632005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1479  hypothetical protein  30.22 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.113343 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  31.58 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  30.46 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  30.46 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00543  IS150 hypothetical protein  29.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.182774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00619  IS150 hypothetical protein  29.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03408  IS150 hypothetical protein  29.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04282  IS150 hypothetical protein  29.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04285  IS150 hypothetical protein  29.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0154  IS103 orf  29.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03359  hypothetical protein  29.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02651  hypothetical protein  29.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03578  hypothetical protein  29.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3759  IS150, transposase orfA  29.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00608  hypothetical protein  29.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00532  hypothetical protein  29.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1073  IS150 transposase orfA  29.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0858431 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3879  IS150 transposase orfA  29.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591141  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>