142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5508 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0123  ISPsy8, transposase OrfA  100 
 
 		 171 aa  355  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0449  ISPsy8, transposase OrfA  100 
 
 		 171 aa  355  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0515  ISPsy8, transposase OrfA  100 
 
 		 171 aa  355  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5065  ISPsy8, transposase OrfA  100 
 
 		 171 aa  355  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5508  ISPsy8, transposase OrfA  100 
 
 		 171 aa  355  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1976  ISPsy8, transposase OrfA  91.81 
 
 		 171 aa  324  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2653  ISPsy8, transposase OrfA  91.81 
 
 		 171 aa  324  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3316  ISPsy8, transposase OrfA  91.81 
 
 		 171 aa  324  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.395591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4859  ISPsy8, transposase OrfA  91.81 
 
 		 171 aa  324  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  42.77 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  37.79 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  37.79 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  42.2 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0274  ISPsy9, transposase OrfA  40.7 
 
 		 179 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0593  ISPsy9, transposase OrfA  40.7 
 
 		 179 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1177  ISPsy9, transposase OrfA  40.7 
 
 		 179 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4617  ISPsy9, transposase OrfA  40.7 
 
 		 179 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765931  normal  0.589726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4679  ISPsy9, transposase OrfA  40.7 
 
 		 179 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5019  ISPsy9, transposase OrfA  40.12 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  40.24 
 
 		 175 aa  110  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  39.16 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  39.16 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  39.16 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  39.16 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  39.16 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  39.16 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  39.16 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  37.71 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  37.71 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  37.71 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  37.71 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  38.04 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  38.04 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  38.04 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  38.04 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  38.04 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  35.59 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  35.59 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  35.59 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0073  putative ISRSO11-transposase orfA protein  34.57 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3619  transposase  30.17 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0336979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0308  transposase, orfA ISRSO11-related  30.23 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3661  transposase  30.23 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  35.19 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2946  transposase IS3/IS911 family protein  32.76 
 
 		 173 aa  84.3  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863972  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0973  transposase IS3/IS911 family protein  32.76 
 
 		 173 aa  84.3  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0982549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3207  transposase IS3/IS911 family protein  32.76 
 
 		 173 aa  84.3  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  35.19 
 
 		 172 aa  84  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  35.19 
 
 		 172 aa  84  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  33.53 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  33.53 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  33.53 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  33.53 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  33.53 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  33.53 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0195  transposase  30.77 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3341  transposase for IS150  29.71 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3592  transposase  29.71 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152849 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1127  IS3 family transposase OrfA  33.33 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00102571  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0057  IS3 family transposase OrfA  33.33 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1198  IS3-family transposase, OrfA  33.33 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010559  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0110  IS3-family transposase, OrfA  33.33 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0382548  hitchhiker  0.00000476368 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  30.63 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  30.63 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  30.63 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  30.63 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  32.14 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  32.14 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  32.14 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  32.14 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  32.14 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  32.14 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  32.14 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  32.14 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  33.1 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  31.79 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  31.79 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0904  transposase IS3/IS911 family protein  32.93 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00246328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1208  transposase IS3/IS911 family protein  32.93 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0207  transposase IS3/IS911 family protein  32.93 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1377  transposase IS3/IS911 family protein  32.93 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0229435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1585  transposase IS3/IS911 family protein  32.93 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1574  transposase IS3/IS911 family protein  32.93 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1162  transposase IS3/IS911 family protein  32.93 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2155  transposase IS3/IS911 family protein  32.93 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2372  transposase IS3/IS911 family protein  32.93 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1596  transposase IS3/IS911 family protein  32.93 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2725  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3879  IS150 transposase orfA  26.83 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591141  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00619  IS150 hypothetical protein  26.83 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04282  IS150 hypothetical protein  26.83 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04285  IS150 hypothetical protein  26.83 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0154  IS103 orf  26.83 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3759  IS150, transposase orfA  26.83 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1073  IS150 transposase orfA  26.83 
 
 		 173 aa  62  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0858431 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>