144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0007 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



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% identity
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Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  100 
 
 		 172 aa  356  9.999999999999999e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  98.84 
 
 		 172 aa  353  5.999999999999999e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  98.84 
 
 		 172 aa  353  5.999999999999999e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  74.27 
 
 		 172 aa  262  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  74.27 
 
 		 172 aa  262  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  74.27 
 
 		 172 aa  262  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  74.27 
 
 		 172 aa  262  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  74.27 
 
 		 172 aa  262  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  74.27 
 
 		 172 aa  262  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  61.63 
 
 		 172 aa  218  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  61.63 
 
 		 172 aa  218  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1056  hypothetical protein  35.26 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.649602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1092  hypothetical protein  35.26 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1363  hypothetical protein  35.26 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1479  hypothetical protein  35.26 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  35.5 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  35.5 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  35.5 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  36.9 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  36.9 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  35.09 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  35.5 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  34.5 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0308  transposase, orfA ISRSO11-related  33.53 
 
 		 172 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3661  transposase  33.53 
 
 		 172 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  34.97 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  33.71 
 
 		 173 aa  90.9  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  33.71 
 
 		 173 aa  90.9  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  33.71 
 
 		 173 aa  90.9  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  33.52 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  33.52 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  33.52 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  33.71 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.96 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.96 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.96 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.96 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.96 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3619  transposase  31.76 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0336979  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3341  transposase for IS150  33.54 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0195  transposase  32.34 
 
 		 172 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0123  ISPsy8, transposase OrfA  35.19 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0449  ISPsy8, transposase OrfA  35.19 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0515  ISPsy8, transposase OrfA  35.19 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5065  ISPsy8, transposase OrfA  35.19 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5508  ISPsy8, transposase OrfA  35.19 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3592  transposase  32.92 
 
 		 165 aa  84  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1976  ISPsy8, transposase OrfA  34.38 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2653  ISPsy8, transposase OrfA  34.38 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3316  ISPsy8, transposase OrfA  34.38 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.395591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4859  ISPsy8, transposase OrfA  34.38 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1127  IS3 family transposase OrfA  28.57 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00102571  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0057  IS3 family transposase OrfA  28.57 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1198  IS3-family transposase, OrfA  28.57 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010559  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0110  IS3-family transposase, OrfA  28.57 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0382548  hitchhiker  0.00000476368 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3207  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2946  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863972  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0973  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0982549 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  31.03 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  31.03 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  31.03 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  31.03 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  32.14 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  31.03 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  31.03 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  31.03 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14510  Transposase  33.12 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.294873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  35.71 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0274  ISPsy9, transposase OrfA  31.58 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0593  ISPsy9, transposase OrfA  31.58 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1177  ISPsy9, transposase OrfA  31.58 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4617  ISPsy9, transposase OrfA  31.58 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765931  normal  0.589726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4679  ISPsy9, transposase OrfA  31.58 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5019  ISPsy9, transposase OrfA  31.58 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0055  IS861, transposase (orf1), IS3 family, truncated  32.18 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0661  transposase  28.57 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.202931  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0881  transposase  28.57 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.77737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1034  transposase  28.57 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.167204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1084  transposase  28.57 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143058  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1669  transposase  28.57 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0415  transposase  28 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0145159  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0318  transposase  30.59 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.199253  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05870  hypothetical protein  33.11 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.786526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15040  hypothetical protein  29.49 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215047  normal  0.865118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1126  transposase and inactivated derivative  27.95 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00000113867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2914  transposase and inactivated derivative  27.95 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_04840  hypothetical protein  33.1 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0242867  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_01650  hypothetical protein  29.49 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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