169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14510 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_14510  Transposase  100 
 
 
171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.294873 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05870  hypothetical protein  70.18 
 
 
171 aa  250  5.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.786526  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04840  hypothetical protein  66.88 
 
 
171 aa  219  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0242867  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2914  transposase and inactivated derivative  56.71 
 
 
167 aa  173  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1126  transposase and inactivated derivative  56.71 
 
 
167 aa  173  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00000113867 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0404  hypothetical protein  53.5 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00316236  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15040  hypothetical protein  50.9 
 
 
167 aa  142  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215047  normal  0.865118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01650  hypothetical protein  50.3 
 
 
167 aa  141  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03240  hypothetical protein  48.37 
 
 
177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311324  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0318  transposase  44.1 
 
 
171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.199253  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  35.26 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  35.26 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  33.12 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  33.12 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  33.12 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3661  transposase  32.68 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0308  transposase, orfA ISRSO11-related  32.68 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3341  transposase for IS150  33.57 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3592  transposase  33.33 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152849 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3619  transposase  32.69 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0336979  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0195  transposase  31.82 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  33.13 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  33.13 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  33.13 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  33.13 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  33.13 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  33.13 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  32.74 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  32.74 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  35.43 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  35.43 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  35.43 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  35.43 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  35.43 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  35.43 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  35.43 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  31.41 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  31.41 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  31.41 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  31.41 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  31.93 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  32.92 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  31.21 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  31.93 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  31.93 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  31.21 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  31.93 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  31.21 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  31.21 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  32.9 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  30.07 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  30.07 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  30.07 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  30.07 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  30.07 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  32.28 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  32.28 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  32.28 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  32.28 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  32.28 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00543  IS150 hypothetical protein  31.33 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.182774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00619  IS150 hypothetical protein  31.33 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03408  IS150 hypothetical protein  31.33 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04282  IS150 hypothetical protein  31.33 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04285  IS150 hypothetical protein  31.33 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0154  IS103 orf  31.33 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00608  hypothetical protein  31.33 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02651  hypothetical protein  31.33 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00532  hypothetical protein  31.33 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3879  IS150 transposase orfA  31.33 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591141  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03359  hypothetical protein  31.33 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03578  hypothetical protein  31.33 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1073  IS150 transposase orfA  31.33 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0858431 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3759  IS150, transposase orfA  31.33 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  26.86 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  26.86 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  26.86 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  29.63 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1198  IS3-family transposase, OrfA  27.59 
 
 
206 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1127  IS3 family transposase OrfA  27.22 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00102571  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0057  IS3 family transposase OrfA  27.22 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0110  IS3-family transposase, OrfA  27.22 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0382548  hitchhiker  0.00000476368 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0848  transposase IS1296EH (ORFA), putative  29.08 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3042  ISBma4, transposase  35.51 
 
 
102 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2249  ISBma4, transposase  35.51 
 
 
102 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2165  ISBma4, transposase  35.51 
 
 
102 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2532  ISBma4, transposase  35.51 
 
 
102 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.409059  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0073  putative ISRSO11-transposase orfA protein  30.38 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0973  transposase IS3/IS911 family protein  29.8 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0982549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2946  transposase IS3/IS911 family protein  29.8 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863972  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3207  transposase IS3/IS911 family protein  29.8 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  27.46 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  37.25 
 
 
100 aa  51.6  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  29.01 
 
 
173 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  29.01 
 
 
173 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  29.01 
 
 
173 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2372  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0207  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1585  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1162  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>