102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03240 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_03240  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  365  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311324  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15040  hypothetical protein  60.37 
 
 
167 aa  191  5e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215047  normal  0.865118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01650  hypothetical protein  59.76 
 
 
167 aa  191  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0318  transposase  51.3 
 
 
171 aa  143  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.199253  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2914  transposase and inactivated derivative  46.58 
 
 
167 aa  141  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1126  transposase and inactivated derivative  46.58 
 
 
167 aa  141  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00000113867 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14510  Transposase  48.37 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.294873 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0404  hypothetical protein  45.7 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00316236  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05870  hypothetical protein  43.33 
 
 
171 aa  120  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.786526  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04840  hypothetical protein  41.89 
 
 
171 aa  114  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0242867  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  31.65 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  31.65 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  31.65 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  31.65 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  31.65 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  31.65 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  31.93 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  35.06 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  35.06 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  35.06 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  35.06 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  35.06 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  31.65 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  28.1 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  28.1 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.87 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.87 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.87 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.87 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.87 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.87 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.87 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  31.06 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  31.06 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  31.06 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3619  transposase  29.75 
 
 
172 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0336979  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0073  putative ISRSO11-transposase orfA protein  29.38 
 
 
175 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0308  transposase, orfA ISRSO11-related  30.43 
 
 
172 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3661  transposase  30.43 
 
 
172 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  32.68 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  32.68 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  32.68 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  32.68 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  32.68 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  30.99 
 
 
178 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  30.99 
 
 
178 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  30.99 
 
 
178 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  31.13 
 
 
171 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  30.99 
 
 
214 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  31.13 
 
 
171 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  31.13 
 
 
171 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  31.13 
 
 
171 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3341  transposase for IS150  28.99 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  29.49 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  32.33 
 
 
142 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  31.51 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  31.51 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3592  transposase  28.26 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152849 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  31.43 
 
 
172 aa  54.3  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  31.43 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  31.43 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1056  hypothetical protein  32.85 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.649602  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1092  hypothetical protein  32.85 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1363  hypothetical protein  32.85 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0632005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1479  hypothetical protein  32.85 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.113343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  26.67 
 
 
173 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  26.67 
 
 
173 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  26.67 
 
 
173 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0195  transposase  27.4 
 
 
172 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  31.39 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  31.39 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  31.39 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  26.67 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0973  transposase IS3/IS911 family protein  30.2 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0982549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2946  transposase IS3/IS911 family protein  30.2 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863972  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3207  transposase IS3/IS911 family protein  30.2 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  31.39 
 
 
173 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0415  transposase  30.71 
 
 
185 aa  47.8  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0145159  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0661  transposase  30.71 
 
 
185 aa  47.8  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.202931  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0881  transposase  30.71 
 
 
185 aa  47.8  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.77737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1034  transposase  30.71 
 
 
185 aa  47.8  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.167204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1084  transposase  30.71 
 
 
185 aa  47.8  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143058  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1669  transposase  30.71 
 
 
185 aa  47.8  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4092  transposase  33.33 
 
 
95 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0016  transposase  34.82 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0207  transposase IS3/IS911 family protein  27.93 
 
 
192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0904  transposase IS3/IS911 family protein  27.93 
 
 
192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00246328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1162  transposase IS3/IS911 family protein  27.93 
 
 
192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1208  transposase IS3/IS911 family protein  27.93 
 
 
192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1377  transposase IS3/IS911 family protein  27.93 
 
 
192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0229435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1574  transposase IS3/IS911 family protein  27.93 
 
 
192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1585  transposase IS3/IS911 family protein  27.93 
 
 
192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1596  transposase IS3/IS911 family protein  27.93 
 
 
192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2155  transposase IS3/IS911 family protein  27.93 
 
 
192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2372  transposase IS3/IS911 family protein  27.93 
 
 
192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1067  IS861, transposase OrfA  32.29 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000711347  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1526  IS861, transposase OrfA  32.29 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.437319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0111  transposase  27.36 
 
 
228 aa  42  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0547  transposase  27.36 
 
 
228 aa  42  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0840  transposase  27.36 
 
 
228 aa  42  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>