141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0840 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0111  transposase  100 
 
 
228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0547  transposase  100 
 
 
228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0840  transposase  100 
 
 
228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0847  transposase  96.49 
 
 
228 aa  437  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0610  hypothetical protein  65.91 
 
 
134 aa  177  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2608  hypothetical protein  40.62 
 
 
223 aa  158  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2173  transposase IS3/IS911 family protein  37.72 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3176  transposase IS3/IS911 family protein  37.72 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1507  transposase  32 
 
 
242 aa  113  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1069  hypothetical protein  36.36 
 
 
237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000554936  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0442  hypothetical protein  36.17 
 
 
199 aa  105  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1358  hypothetical protein  36.17 
 
 
199 aa  105  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3216  transposase IS3/IS911 family protein  39.74 
 
 
158 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1655  hypothetical protein  42.45 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0853  transposase  32.5 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2416  transposase  32.5 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4090  hypothetical protein  47.54 
 
 
94 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4092  transposase  36.56 
 
 
95 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  27.6 
 
 
505 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  27.6 
 
 
505 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1343  transposase IS3/IS911 family protein  28.28 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0661  transposase  25 
 
 
185 aa  52.4  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.202931  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0881  transposase  25 
 
 
185 aa  52.4  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.77737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1034  transposase  25 
 
 
185 aa  52.4  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.167204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1084  transposase  25 
 
 
185 aa  52.4  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143058  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1669  transposase  25 
 
 
185 aa  52.4  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1585  transposase IS3/IS911 family protein  30.09 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1574  transposase IS3/IS911 family protein  30.09 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1377  transposase IS3/IS911 family protein  30.09 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0229435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2155  transposase IS3/IS911 family protein  30.09 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1596  transposase IS3/IS911 family protein  30.09 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1208  transposase IS3/IS911 family protein  30.09 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2372  transposase IS3/IS911 family protein  30.09 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  24.29 
 
 
177 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  24.29 
 
 
177 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0904  transposase IS3/IS911 family protein  30.09 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00246328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1162  transposase IS3/IS911 family protein  30.09 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0207  transposase IS3/IS911 family protein  30.09 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2708  transposase IS3/IS911  25.45 
 
 
288 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710793  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  26.61 
 
 
515 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0415  transposase  24.4 
 
 
185 aa  48.9  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0145159  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  23.53 
 
 
512 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  23.53 
 
 
512 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  26.52 
 
 
512 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  23.53 
 
 
512 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00543  IS150 hypothetical protein  33.78 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.182774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00619  IS150 hypothetical protein  33.78 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03408  IS150 hypothetical protein  33.78 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04282  IS150 hypothetical protein  33.78 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04285  IS150 hypothetical protein  33.78 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0154  IS103 orf  33.78 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1073  IS150 transposase orfA  33.78 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0858431 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3879  IS150 transposase orfA  33.78 
 
 
173 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591141  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00532  hypothetical protein  33.78 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3759  IS150, transposase orfA  33.78 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00608  hypothetical protein  33.78 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03359  hypothetical protein  33.78 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02651  hypothetical protein  33.78 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03578  hypothetical protein  33.78 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1976  ISPsy8, transposase OrfA  26.01 
 
 
171 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2653  ISPsy8, transposase OrfA  26.01 
 
 
171 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3316  ISPsy8, transposase OrfA  26.01 
 
 
171 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.395591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4859  ISPsy8, transposase OrfA  26.01 
 
 
171 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  40.35 
 
 
395 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1409  integrase, catalytic region  44 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  40.35 
 
 
395 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  40.35 
 
 
395 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  40.35 
 
 
395 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  40.35 
 
 
395 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  40.35 
 
 
395 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.406047 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  24.7 
 
 
173 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  24.7 
 
 
173 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0123  ISPsy8, transposase OrfA  25 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0449  ISPsy8, transposase OrfA  25 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0515  ISPsy8, transposase OrfA  25 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5065  ISPsy8, transposase OrfA  25 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5508  ISPsy8, transposase OrfA  25 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0308  transposase, orfA ISRSO11-related  26.04 
 
 
172 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3619  transposase  26.04 
 
 
172 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0336979  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3661  transposase  26.04 
 
 
172 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0012  IS3 family transposase  33.33 
 
 
172 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.581726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  24.7 
 
 
173 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  24.7 
 
 
173 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3341  transposase for IS150  26.63 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3592  transposase  26.63 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152849 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0195  transposase  27.35 
 
 
172 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  23.76 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1098  transposase  32.32 
 
 
106 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93923e-58 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0508  transposase  32.32 
 
 
106 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1366  transposase  32.32 
 
 
106 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38752e-22 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  23.76 
 
 
171 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  23.76 
 
 
171 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  23.76 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  23.76 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  23.76 
 
 
171 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  23.76 
 
 
171 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1193  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 
98 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.062228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0346  transposase  32.32 
 
 
106 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1521  transposase  32.32 
 
 
106 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6028199999999995e-37 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  24 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>