93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0016 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0016  transposase  100 
 
 		 178 aa  357  6e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0055  IS861, transposase (orf1), IS3 family, truncated  84.3 
 
 		 172 aa  281  3.0000000000000004e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1526  IS861, transposase OrfA  67.98 
 
 		 178 aa  243  8e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.437319  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1067  IS861, transposase OrfA  67.98 
 
 		 178 aa  243  8e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000711347  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1360  transposase  70.13 
 
 		 169 aa  209  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.452785  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1757  transposase  95.74 
 
 		 94 aa  186  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1418  transposase  94.32 
 
 		 88 aa  167  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0365  transposase  98.39 
 
 		 62 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1758  transposase  98.39 
 
 		 62 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1419  transposase  85.07 
 
 		 69 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0366  transposase  85.71 
 
 		 63 aa  112  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  30.97 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  30.97 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  30.97 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  30.97 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  30.97 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  30.97 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1346  hypothetical protein  41.27 
 
 		 65 aa  60.8  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  31.61 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  31.61 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  31.61 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  28.05 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  28.05 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  28.05 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  28.05 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  29.68 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  29.68 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  29.68 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  29.68 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  29.68 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  29.68 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  29.68 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  29.68 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  27.91 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  31.25 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  27.33 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  27.33 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  30.5 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03240  hypothetical protein  34.82 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  27.63 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  27.63 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  27.63 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  27.63 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  27.63 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  27.63 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  27.63 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  30.64 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0881  transposase  27.27 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.77737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2608  hypothetical protein  26.52 
 
 		 223 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3879  IS150 transposase orfA  26.67 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1034  transposase  27.27 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.167204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1084  transposase  27.27 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143058  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0661  transposase  27.27 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.202931  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1507  transposase  28.67 
 
 		 242 aa  44.7  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1669  transposase  27.27 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00543  IS150 hypothetical protein  26.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.182774  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03578  hypothetical protein  26.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00608  hypothetical protein  26.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00532  hypothetical protein  26.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  30.2 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  30.2 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02651  hypothetical protein  26.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03359  hypothetical protein  26.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1073  IS150 transposase orfA  26.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0858431 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3759  IS150, transposase orfA  26.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00619  IS150 hypothetical protein  26.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  30.2 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03408  IS150 hypothetical protein  26.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04282  IS150 hypothetical protein  26.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04285  IS150 hypothetical protein  26.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  30.2 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0154  IS103 orf  26.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  25 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  25 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0853  transposase  26.49 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2416  transposase  25.29 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15040  hypothetical protein  28.21 
 
 		 167 aa  42  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215047  normal  0.865118 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1056  hypothetical protein  24.42 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.649602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1092  hypothetical protein  24.42 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01650  hypothetical protein  28.21 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1363  hypothetical protein  24.42 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1479  hypothetical protein  24.42 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>