143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0289 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  71.07 
 
 
174 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  71.07 
 
 
174 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  71.07 
 
 
174 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  71.07 
 
 
174 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  71.07 
 
 
174 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  62.86 
 
 
175 aa  208  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  62.86 
 
 
175 aa  208  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  62.86 
 
 
175 aa  208  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  62.86 
 
 
175 aa  208  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  62.86 
 
 
175 aa  208  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  62.86 
 
 
175 aa  208  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  62.86 
 
 
175 aa  208  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  55.68 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  55.68 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  55.68 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  52.76 
 
 
175 aa  170  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  49.71 
 
 
178 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  49.14 
 
 
178 aa  160  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  58.87 
 
 
142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5019  ISPsy9, transposase OrfA  49.44 
 
 
179 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0274  ISPsy9, transposase OrfA  49.44 
 
 
179 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0593  ISPsy9, transposase OrfA  49.44 
 
 
179 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1177  ISPsy9, transposase OrfA  49.44 
 
 
179 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4617  ISPsy9, transposase OrfA  49.44 
 
 
179 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765931  normal  0.589726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4679  ISPsy9, transposase OrfA  49.44 
 
 
179 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  40.45 
 
 
177 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  40.45 
 
 
177 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3207  transposase IS3/IS911 family protein  45.4 
 
 
173 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0973  transposase IS3/IS911 family protein  45.4 
 
 
173 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0982549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2946  transposase IS3/IS911 family protein  45.4 
 
 
173 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863972  normal  0.226837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  42.05 
 
 
173 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  42.05 
 
 
173 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  42.05 
 
 
173 aa  124  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  42.05 
 
 
173 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0073  putative ISRSO11-transposase orfA protein  42.94 
 
 
175 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1976  ISPsy8, transposase OrfA  40.68 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2653  ISPsy8, transposase OrfA  40.68 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3316  ISPsy8, transposase OrfA  40.68 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.395591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4859  ISPsy8, transposase OrfA  40.68 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0123  ISPsy8, transposase OrfA  38.64 
 
 
171 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0449  ISPsy8, transposase OrfA  38.64 
 
 
171 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0515  ISPsy8, transposase OrfA  38.64 
 
 
171 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5065  ISPsy8, transposase OrfA  38.64 
 
 
171 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5508  ISPsy8, transposase OrfA  38.64 
 
 
171 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  36.63 
 
 
172 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  36.63 
 
 
172 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  36.63 
 
 
172 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  36.63 
 
 
172 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  36.63 
 
 
172 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  36.63 
 
 
172 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2725  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  62.34 
 
 
91 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  37.79 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  37.79 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0318  transposase  39.29 
 
 
171 aa  95.1  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.199253  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1056  hypothetical protein  34.13 
 
 
180 aa  95.1  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.649602  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1092  hypothetical protein  34.13 
 
 
180 aa  95.1  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1363  hypothetical protein  34.13 
 
 
180 aa  95.1  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0632005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1479  hypothetical protein  34.13 
 
 
180 aa  95.1  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.113343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1127  IS3 family transposase OrfA  33.14 
 
 
173 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00102571  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0057  IS3 family transposase OrfA  33.14 
 
 
173 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1198  IS3-family transposase, OrfA  33.14 
 
 
206 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010559  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0110  IS3-family transposase, OrfA  33.14 
 
 
173 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0382548  hitchhiker  0.00000476368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01650  hypothetical protein  37.64 
 
 
167 aa  92.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15040  hypothetical protein  37.64 
 
 
167 aa  92.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215047  normal  0.865118 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  33.72 
 
 
172 aa  87.4  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  30.46 
 
 
173 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  30.46 
 
 
173 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  30.46 
 
 
173 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  30.46 
 
 
173 aa  87.4  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  31.98 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  31.98 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3619  transposase  27.93 
 
 
172 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0336979  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0308  transposase, orfA ISRSO11-related  28.98 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3661  transposase  28.98 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3879  IS150 transposase orfA  31.14 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591141  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00543  IS150 hypothetical protein  31.14 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.182774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00619  IS150 hypothetical protein  31.14 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03408  IS150 hypothetical protein  31.14 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04282  IS150 hypothetical protein  31.14 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04285  IS150 hypothetical protein  31.14 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0154  IS103 orf  31.14 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03578  hypothetical protein  31.14 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00532  hypothetical protein  31.14 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03359  hypothetical protein  31.14 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02651  hypothetical protein  31.14 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00608  hypothetical protein  31.14 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3759  IS150, transposase orfA  31.14 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1073  IS150 transposase orfA  31.14 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0858431 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  33.33 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  33.33 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  33.33 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  33.33 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  33.33 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  33.33 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  33.33 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382773 
 
 
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