122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0881 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0661  transposase  100 
 
 
185 aa  380  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.202931  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0881  transposase  100 
 
 
185 aa  380  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.77737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1034  transposase  100 
 
 
185 aa  380  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.167204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1084  transposase  100 
 
 
185 aa  380  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143058  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1669  transposase  100 
 
 
185 aa  380  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0415  transposase  98.38 
 
 
185 aa  372  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0145159  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0853  transposase  36.84 
 
 
193 aa  107  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2416  transposase  36.84 
 
 
193 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1596  transposase IS3/IS911 family protein  34.76 
 
 
192 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2155  transposase IS3/IS911 family protein  34.76 
 
 
192 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1208  transposase IS3/IS911 family protein  34.76 
 
 
192 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1162  transposase IS3/IS911 family protein  34.76 
 
 
192 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0904  transposase IS3/IS911 family protein  34.76 
 
 
192 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00246328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1574  transposase IS3/IS911 family protein  34.76 
 
 
192 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1377  transposase IS3/IS911 family protein  34.76 
 
 
192 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0229435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1585  transposase IS3/IS911 family protein  34.76 
 
 
192 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2372  transposase IS3/IS911 family protein  34.76 
 
 
192 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0207  transposase IS3/IS911 family protein  34.76 
 
 
192 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.84 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.84 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.84 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.84 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.84 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.84 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.84 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.13 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.13 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.13 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.13 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  33.13 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  28.57 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  28.57 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  28.57 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.93 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.93 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.93 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.93 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.93 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  30.06 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  30.06 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  30.06 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  30.06 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  30.06 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  30.06 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  30.25 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  29.63 
 
 
178 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  28.12 
 
 
177 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  28.12 
 
 
177 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  28.12 
 
 
177 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5019  ISPsy9, transposase OrfA  28.57 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0274  ISPsy9, transposase OrfA  28.57 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0593  ISPsy9, transposase OrfA  28.57 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1177  ISPsy9, transposase OrfA  28.57 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4617  ISPsy9, transposase OrfA  28.57 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765931  normal  0.589726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4679  ISPsy9, transposase OrfA  28.57 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  30.85 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  30.85 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  31.74 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  31.74 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  31.74 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1521  transposase  38.14 
 
 
106 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6028199999999995e-37 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1366  transposase  38.14 
 
 
106 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38752e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0346  transposase  38.14 
 
 
106 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0508  transposase  38.14 
 
 
106 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1098  transposase  38.14 
 
 
106 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93923e-58 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  27.04 
 
 
175 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  31.14 
 
 
173 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0514  transposase  38.14 
 
 
125 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1313  transposase  38.14 
 
 
125 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000204726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2023  transposase  38.14 
 
 
125 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2861  IS150-like protein  38.14 
 
 
125 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.476556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2995  transposase  38.14 
 
 
125 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4076  transposase  38.14 
 
 
125 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0985983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0123  ISPsy8, transposase OrfA  28.74 
 
 
171 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0449  ISPsy8, transposase OrfA  28.74 
 
 
171 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0515  ISPsy8, transposase OrfA  28.74 
 
 
171 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5065  ISPsy8, transposase OrfA  28.74 
 
 
171 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5508  ISPsy8, transposase OrfA  28.74 
 
 
171 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1507  transposase  33.94 
 
 
242 aa  54.7  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  23.3 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  23.3 
 
 
214 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  23.3 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  23.3 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  23.3 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  23.3 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  23.3 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  23.3 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0111  transposase  25 
 
 
228 aa  52.4  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0547  transposase  25 
 
 
228 aa  52.4  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0840  transposase  25 
 
 
228 aa  52.4  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1976  ISPsy8, transposase OrfA  28.31 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2653  ISPsy8, transposase OrfA  28.31 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3316  ISPsy8, transposase OrfA  28.31 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.395591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4859  ISPsy8, transposase OrfA  28.31 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0847  transposase  25 
 
 
228 aa  52.4  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0073  putative ISRSO11-transposase orfA protein  28.4 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15040  hypothetical protein  30.49 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215047  normal  0.865118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01650  hypothetical protein  30.49 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2725  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  36.76 
 
 
91 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4092  transposase  37.36 
 
 
95 aa  47.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>