136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0853 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0853  transposase  100 
 
 		 193 aa  396  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2416  transposase  99.48 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0661  transposase  36.84 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.202931  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0881  transposase  36.84 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.77737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1034  transposase  36.84 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.167204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1084  transposase  36.84 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143058  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1669  transposase  36.84 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2155  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1596  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1208  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1162  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0904  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00246328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1574  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1585  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1377  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0229435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2372  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0207  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0415  transposase  35.26 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0145159  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  32.76 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0073  putative ISRSO11-transposase orfA protein  33.53 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  29.14 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  29.14 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  29.14 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  29.88 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  29.88 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  29.88 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  29.88 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  29.88 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  29.88 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1507  transposase  34.31 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1343  transposase IS3/IS911 family protein  27.71 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  31.29 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  29.78 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0111  transposase  32.5 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0547  transposase  32.5 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0840  transposase  32.5 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0847  transposase  32.5 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  29.78 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  29.78 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  29.78 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  30.43 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  30.43 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  28.14 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  26.63 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  26.63 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  27.54 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  27.54 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2608  hypothetical protein  29.25 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  24.86 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  24.42 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  24.42 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  24.42 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  24.86 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  24.42 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  24.86 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  24.86 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0274  ISPsy9, transposase OrfA  28.41 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0593  ISPsy9, transposase OrfA  28.41 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1177  ISPsy9, transposase OrfA  28.41 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4617  ISPsy9, transposase OrfA  28.41 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765931  normal  0.589726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4679  ISPsy9, transposase OrfA  28.41 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  27.34 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5019  ISPsy9, transposase OrfA  28.41 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1976  ISPsy8, transposase OrfA  27.65 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2653  ISPsy8, transposase OrfA  27.65 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3316  ISPsy8, transposase OrfA  27.65 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.395591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4859  ISPsy8, transposase OrfA  27.65 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0848  transposase IS1296EH (ORFA), putative  24.84 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01650  hypothetical protein  27.38 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15040  hypothetical protein  27.38 
 
 		 167 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215047  normal  0.865118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0123  ISPsy8, transposase OrfA  26.82 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0449  ISPsy8, transposase OrfA  26.82 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0515  ISPsy8, transposase OrfA  26.82 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5065  ISPsy8, transposase OrfA  26.82 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5508  ISPsy8, transposase OrfA  26.82 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  29.07 
 
 		 173 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  29.07 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  29.07 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  29.07 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1366  transposase  44.64 
 
 		 106 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38752e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0346  transposase  44.64 
 
 		 106 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2173  transposase IS3/IS911 family protein  26.52 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>