88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2608 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2608  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1507  transposase  39.46 
 
 		 242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0847  transposase  41.52 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0840  transposase  40.62 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0547  transposase  40.62 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0111  transposase  40.62 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1069  hypothetical protein  36.89 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000554936  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2173  transposase IS3/IS911 family protein  37.62 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3176  transposase IS3/IS911 family protein  37.62 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1358  hypothetical protein  36.56 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0442  hypothetical protein  36.56 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0610  hypothetical protein  43.07 
 
 		 134 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3216  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 158 aa  108  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1655  hypothetical protein  42.57 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4090  hypothetical protein  51.56 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4092  transposase  37.63 
 
 		 95 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2416  transposase  29.25 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0853  transposase  29.25 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1592  integrase catalytic subunit  29.63 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0996  hypothetical protein  32.04 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000378189  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0318  transposase  25.26 
 
 		 171 aa  53.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.199253  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1343  transposase IS3/IS911 family protein  24.6 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1162  transposase IS3/IS911 family protein  26.47 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  24 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  25.81 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  24 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  24 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  24 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2372  transposase IS3/IS911 family protein  26.47 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2155  transposase IS3/IS911 family protein  26.47 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1596  transposase IS3/IS911 family protein  26.47 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1585  transposase IS3/IS911 family protein  26.47 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1574  transposase IS3/IS911 family protein  26.47 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1377  transposase IS3/IS911 family protein  26.47 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0229435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0207  transposase IS3/IS911 family protein  26.47 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0904  transposase IS3/IS911 family protein  26.47 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00246328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1208  transposase IS3/IS911 family protein  26.47 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  24 
 
 		 178 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  23.3 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  24 
 
 		 178 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  24 
 
 		 178 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  25.49 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  25.49 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  25.49 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  23.29 
 
 		 515 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  21.66 
 
 		 505 aa  45.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1521  transposase  53.33 
 
 		 106 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6028199999999995e-37 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0346  transposase  53.33 
 
 		 106 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  21.66 
 
 		 505 aa  45.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1366  transposase  53.33 
 
 		 106 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38752e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1098  transposase  53.33 
 
 		 106 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93923e-58 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0508  transposase  53.33 
 
 		 106 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3619  transposase  32.65 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0336979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02159  hypothetical protein  25.24 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  25.24 
 
 		 173 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01650  hypothetical protein  23.85 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  25.24 
 
 		 173 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15040  hypothetical protein  23.85 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215047  normal  0.865118 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4679  ISPsy9, transposase OrfA  26.04 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  25.24 
 
 		 173 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0514  transposase  53.33 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1313  transposase  53.33 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000204726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2023  transposase  53.33 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000284165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2861  IS150-like protein  53.33 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.476556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2995  transposase  53.33 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4076  transposase  53.33 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0985983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0274  ISPsy9, transposase OrfA  26.04 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0593  ISPsy9, transposase OrfA  26.04 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1177  ISPsy9, transposase OrfA  26.04 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4617  ISPsy9, transposase OrfA  26.04 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765931  normal  0.589726 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  24.49 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  24.49 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  24.49 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  24.49 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  24.49 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0016  transposase  26.52 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  27.18 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  22.33 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2725  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  25.3 
 
 		 91 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3661  transposase  31.63 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0308  transposase, orfA ISRSO11-related  31.63 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1526  IS861, transposase OrfA  28.57 
 
 		 178 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.437319  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1067  IS861, transposase OrfA  28.57 
 
 		 178 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000711347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5019  ISPsy9, transposase OrfA  26.04 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  25.77 
 
 		 173 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0195  transposase  30.93 
 
 		 172 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  23.35 
 
 		 512 aa  41.6  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  23.35 
 
 		 512 aa  41.6  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>