More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1592 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1592  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 464 aa  970    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0996  hypothetical protein  96.88 
 
 		 224 aa  450  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000378189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0995  integrase catalytic subunit  98.02 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000156889  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2415  transposase  38.35 
 
 		 287 aa  183  7e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  38.02 
 
 		 277 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  38.02 
 
 		 277 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  38.02 
 
 		 277 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  38.46 
 
 		 269 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C34  transposase  36.54 
 
 		 298 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  39.39 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  36.5 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  39.39 
 
 		 265 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  36.13 
 
 		 277 aa  169  7e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  36.14 
 
 		 283 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  36.14 
 
 		 283 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  36.14 
 
 		 283 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  36.14 
 
 		 283 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  36.14 
 
 		 283 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  36.14 
 
 		 283 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  36.14 
 
 		 283 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  36.14 
 
 		 283 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  37.55 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  36.14 
 
 		 283 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  36.14 
 
 		 283 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  36.14 
 
 		 283 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  36.14 
 
 		 283 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  36.63 
 
 		 270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  36.63 
 
 		 270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  36.63 
 
 		 270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  38.27 
 
 		 248 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  38.27 
 
 		 248 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  38.27 
 
 		 248 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  38.27 
 
 		 248 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  38.27 
 
 		 248 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  38.27 
 
 		 248 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  38.27 
 
 		 248 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  34.41 
 
 		 278 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  36.3 
 
 		 268 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  37.86 
 
 		 248 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  35.93 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  35.93 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  35.93 
 
 		 268 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  36.36 
 
 		 259 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  36.36 
 
 		 259 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  36.36 
 
 		 259 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  36.36 
 
 		 259 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  35.93 
 
 		 268 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  35.93 
 
 		 268 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  36.36 
 
 		 259 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  35.77 
 
 		 278 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  35.77 
 
 		 278 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  35.77 
 
 		 278 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  35.77 
 
 		 278 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  35.77 
 
 		 278 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0416  transposase  38.66 
 
 		 272 aa  163  7e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0878674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  35.77 
 
 		 278 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  35.56 
 
 		 278 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  35.56 
 
 		 278 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  35.71 
 
 		 279 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  35.71 
 
 		 279 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  35.71 
 
 		 279 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  35.98 
 
 		 260 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0662  transposase  38.2 
 
 		 273 aa  161  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  35.71 
 
 		 279 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1035  transposase  37.45 
 
 		 273 aa  161  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0448539  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1085  transposase  37.45 
 
 		 273 aa  161  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  36.69 
 
 		 278 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  36.69 
 
 		 278 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  36.69 
 
 		 278 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  36.69 
 
 		 278 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  35.13 
 
 		 270 aa  160  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  35.13 
 
 		 270 aa  160  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0882  transposase  37.55 
 
 		 272 aa  159  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0194  transposase  36.88 
 
 		 253 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  34.05 
 
 		 278 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  34.05 
 
 		 278 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  34.05 
 
 		 278 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  34.05 
 
 		 278 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  35 
 
 		 278 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  34.29 
 
 		 278 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  34.29 
 
 		 278 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0208  Integrase catalytic region  32.96 
 
 		 266 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2371  Integrase catalytic region  32.96 
 
 		 266 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0905  Integrase catalytic region  32.96 
 
 		 266 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000083708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1573  Integrase catalytic region  32.96 
 
 		 266 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1163  Integrase catalytic region  32.96 
 
 		 266 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1584  Integrase catalytic region  32.96 
 
 		 266 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1595  Integrase catalytic region  32.96 
 
 		 266 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2154  Integrase catalytic region  32.96 
 
 		 266 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1378  Integrase catalytic region  32.96 
 
 		 266 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1209  Integrase catalytic region  32.96 
 
 		 266 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  33.69 
 
 		 278 aa  156  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  34.43 
 
 		 269 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  36.63 
 
 		 249 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  36.63 
 
 		 249 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  33.93 
 
 		 278 aa  154  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4172  integrase core subunit  34.47 
 
 		 261 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3804  integrase core subunit  34.47 
 
 		 261 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0196  integrase core subunit  34.47 
 
 		 261 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0908  integrase core subunit  34.47 
 
 		 261 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>