138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04840 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04840  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  346  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0242867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05870  hypothetical protein  88.89 
 
 		 171 aa  311  2.9999999999999996e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.786526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14510  Transposase  67.25 
 
 		 171 aa  235  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.294873 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1126  transposase and inactivated derivative  60.87 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.106432  hitchhiker  0.00000113867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2914  transposase and inactivated derivative  60.87 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0404  hypothetical protein  54.14 
 
 		 165 aa  167  9e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00316236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15040  hypothetical protein  47.59 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215047  normal  0.865118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01650  hypothetical protein  46.99 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0318  transposase  45.62 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.199253  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03240  hypothetical protein  42 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  35.54 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  35.54 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  35.54 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  35.54 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  35.54 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  35.54 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  35.54 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  35.54 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  34.76 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0297  ISPsy8, transposase OrfA  31.41 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1431  ISPsy8, transposase OrfA  31.41 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  34.15 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  31.68 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  31.68 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  31.68 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0308  transposase, orfA ISRSO11-related  28.48 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  30.25 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  30.25 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  30.25 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  30.25 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  30.25 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  30.25 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3661  transposase  28.48 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3619  transposase  28.48 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0336979  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3341  transposase for IS150  30.56 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0195  transposase  27.85 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  28.24 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  28.24 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3592  transposase  29.86 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152849 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  28.48 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  28.48 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  28.48 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3207  transposase IS3/IS911 family protein  31.37 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2946  transposase IS3/IS911 family protein  31.37 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863972  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0973  transposase IS3/IS911 family protein  31.37 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0982549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  28.48 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  27.92 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3879  IS150 transposase orfA  31.54 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591141  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00543  IS150 hypothetical protein  31.54 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.182774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00619  IS150 hypothetical protein  31.54 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03408  IS150 hypothetical protein  31.54 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04282  IS150 hypothetical protein  31.54 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04285  IS150 hypothetical protein  31.54 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0154  IS103 orf  31.54 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1127  IS3 family transposase OrfA  27.21 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00102571  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0057  IS3 family transposase OrfA  27.21 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00608  hypothetical protein  31.54 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1198  IS3-family transposase, OrfA  27.21 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010559  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0110  IS3-family transposase, OrfA  27.21 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0382548  hitchhiker  0.00000476368 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02651  hypothetical protein  31.54 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03359  hypothetical protein  31.54 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03578  hypothetical protein  31.54 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00532  hypothetical protein  31.54 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3759  IS150, transposase orfA  31.54 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1073  IS150 transposase orfA  31.54 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0858431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5019  ISPsy9, transposase OrfA  28.93 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0274  ISPsy9, transposase OrfA  28.3 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0593  ISPsy9, transposase OrfA  28.3 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1177  ISPsy9, transposase OrfA  28.3 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4617  ISPsy9, transposase OrfA  28.3 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765931  normal  0.589726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4679  ISPsy9, transposase OrfA  28.3 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  25 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  25 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  25 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02199  probable ISRSO11-transposase OrfA protein  26.03 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04290  transposase  26.03 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02376  hypothetical protein  26.03 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  27.91 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0415  transposase  28.39 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0145159  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0661  transposase  30.13 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.202931  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0881  transposase  30.13 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.77737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1034  transposase  30.13 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.167204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1084  transposase  30.13 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>