71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0055 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0055  IS861, transposase (orf1), IS3 family, truncated  100 
 
 		 172 aa  347  5e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0016  transposase  84.3 
 
 		 178 aa  281  3.0000000000000004e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1360  transposase  72.09 
 
 		 169 aa  217  6e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.452785  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1067  IS861, transposase OrfA  62.79 
 
 		 178 aa  216  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000711347  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1526  IS861, transposase OrfA  62.79 
 
 		 178 aa  216  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.437319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1757  transposase  96.81 
 
 		 94 aa  187  5.999999999999999e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1419  transposase  87.69 
 
 		 69 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1418  transposase  73.17 
 
 		 88 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0366  transposase  84.13 
 
 		 63 aa  108  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  32.54 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  32.54 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  32.54 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  32.54 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  32.54 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  32.54 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  32.18 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  31.61 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  31.61 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1758  transposase  66.07 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0365  transposase  64.29 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  31.1 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  31.1 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  31.1 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  27.59 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  27.59 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  31.1 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1346  hypothetical protein  38.1 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  31.13 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  31.13 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  31.13 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  31.13 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  31.13 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  31.13 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  31.13 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  31.13 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  31.79 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  31.79 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  31.79 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1056  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.649602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1092  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1363  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1479  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1563  ISRSO11-transposase orfA protein  31.91 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.724659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1741  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2398  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2939  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3345  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3911  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400255  normal  0.811866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2266  ISRSO11-transposase orfA protein  31.43 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4457  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4859  ISPsy8, transposase OrfA  29.56 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  30.19 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3316  ISPsy8, transposase OrfA  29.56 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.395591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2653  ISPsy8, transposase OrfA  29.56 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1976  ISPsy8, transposase OrfA  29.56 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0449  ISPsy8, transposase OrfA  28.29 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0515  ISPsy8, transposase OrfA  28.29 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5508  ISPsy8, transposase OrfA  28.29 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5065  ISPsy8, transposase OrfA  28.29 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0123  ISPsy8, transposase OrfA  28.29 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0973  transposase IS3/IS911 family protein  26.35 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0982549 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04840  hypothetical protein  28.28 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0242867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3207  transposase IS3/IS911 family protein  26.35 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2946  transposase IS3/IS911 family protein  26.35 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863972  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5560  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686741  normal  0.288949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0289  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00730754  normal  0.345935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1168  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1338  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.543721  hitchhiker  0.00590953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3940  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>