66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1360 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1360  transposase  100 
 
 
169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.452785  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0055  IS861, transposase (orf1), IS3 family, truncated  72.09 
 
 
172 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0016  transposase  66.86 
 
 
178 aa  217  7.999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1067  IS861, transposase OrfA  66.28 
 
 
178 aa  216  8.999999999999998e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000711347  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1526  IS861, transposase OrfA  66.28 
 
 
178 aa  216  8.999999999999998e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.437319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1757  transposase  70.21 
 
 
94 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0366  transposase  73.02 
 
 
63 aa  95.5  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1419  transposase  64.18 
 
 
69 aa  90.1  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1418  transposase  62.96 
 
 
88 aa  87.8  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1346  hypothetical protein  44.44 
 
 
65 aa  60.8  0.000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0007  IS3/IS911 family transposase orfA  29.89 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.875163  hitchhiker  0.000690701 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1458  IS3/IS911 family transposase orfA  29.89 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402508  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1787  IS3/IS911 family transposase orfA  29.89 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0391  transposase IS3/IS911  31.28 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0747  transposase IS3/IS911  31.28 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.990692  normal  0.477899 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1578  transposase IS3/IS911  30.91 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2438  transposase IS3/IS911  30.91 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2411  transposase IS3/IS911  30.91 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.703252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2076  transposase IS3/IS911  30.91 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.198019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0847  transposase IS3/IS911  30.91 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.412731  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0718  transposase IS3/IS911  30.91 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4171  transposase  29.87 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382773 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3803  transposase  29.87 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3758  transposase  29.87 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0909  insertion element DNA-binding protein  29.87 
 
 
214 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3901  transposase  29.87 
 
 
171 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0197  IS3 family transposase  29.87 
 
 
171 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0187558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3123  transposase  29.87 
 
 
171 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000313575  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3997  IS3 family transposase  29.87 
 
 
171 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1017  transposase  28.66 
 
 
173 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1281  transposase  28.66 
 
 
173 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4382  transposase  28.66 
 
 
173 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4364  transposase  28.07 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0678779  hitchhiker  1.77639e-22 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01650  hypothetical protein  29.45 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15040  hypothetical protein  29.45 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215047  normal  0.865118 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2409  ISRSO11-transposase orfA protein  31.79 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1437  ISRSO11-transposase ORFA protein  31.79 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3090  ISRSO11-transposase orfA protein  31.79 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1758  transposase  58.93 
 
 
62 aa  45.4  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0853  transposase  25.14 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0365  transposase  57.14 
 
 
62 aa  45.1  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1669  transposase  28.24 
 
 
185 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1084  transposase  28.24 
 
 
185 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143058  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1034  transposase  28.24 
 
 
185 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.167204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0881  transposase  28.24 
 
 
185 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.77737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0661  transposase  28.24 
 
 
185 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.202931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1127  IS3 family transposase OrfA  29.58 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00102571  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0057  IS3 family transposase OrfA  29.58 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1198  IS3-family transposase, OrfA  29.58 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010559  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0110  IS3-family transposase, OrfA  29.58 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0382548  hitchhiker  0.00000476368 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2416  transposase  24.59 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0318  transposase  26.14 
 
 
171 aa  42.4  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.199253  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05870  hypothetical protein  27.1 
 
 
171 aa  42  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.786526  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4859  ISPsy8, transposase OrfA  26.83 
 
 
171 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3316  ISPsy8, transposase OrfA  26.83 
 
 
171 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.395591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2653  ISPsy8, transposase OrfA  26.83 
 
 
171 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1976  ISPsy8, transposase OrfA  26.83 
 
 
171 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1479  hypothetical protein  24.28 
 
 
180 aa  41.6  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.113343 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1363  hypothetical protein  24.28 
 
 
180 aa  41.6  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0632005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1092  hypothetical protein  24.28 
 
 
180 aa  41.6  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1056  hypothetical protein  24.28 
 
 
180 aa  41.6  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.649602  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1445  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  27.86 
 
 
174 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.518244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0813  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  27.86 
 
 
174 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2563  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  27.86 
 
 
174 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2713  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  27.86 
 
 
174 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6206  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  27.86 
 
 
174 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>