62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3764 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3764  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  100 
 
 		 288 aa  597  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0204504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4129  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.87 
 
 		 406 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1669  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.75 
 
 		 173 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.761458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3323  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  33.56 
 
 		 150 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.29 
 
 		 157 aa  87  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.89 
 
 		 150 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3698  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.89 
 
 		 150 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3670  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.21 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0492519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3666  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  32.21 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1572  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.89 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.577314  normal  0.236623 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3648  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.89 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3389  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.89 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0561834  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3340  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.89 
 
 		 152 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3745  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.89 
 
 		 150 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1925  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase  34.75 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0536095  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  33.74 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0545  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.93 
 
 		 157 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0529  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase, putative  34.93 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.549299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2269  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  33.11 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0638229  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1862  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  32.17 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.108984 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.58 
 
 		 542 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.04 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5274  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  32.89 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0099  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  26.84 
 
 		 552 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4840  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  32.39 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  36.62 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3347  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  38.89 
 
 		 194 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5070  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.65 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.43 
 
 		 879 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0417  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.88 
 
 		 905 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  31.76 
 
 		 698 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.16 
 
 		 356 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2224  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.14 
 
 		 219 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2272  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.71 
 
 		 223 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.73 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3051  negative regulator of AmpC, AmpD  27.14 
 
 		 234 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.8874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2393  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.04 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0021339  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  32.98 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0947  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.29 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal  0.768005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1972  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.21 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.289767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2719  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1916  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.22 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  42.22 
 
 		 532 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4242  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.26 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.26707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  29.17 
 
 		 654 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0960  AmpD (negative regulator of AmpC)  29.71 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0865958  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  43.48 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4944  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.78 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.038406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1929  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  27.38 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2707  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.03 
 
 		 184 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000658239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.7 
 
 		 694 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0428  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  40.79 
 
 		 205 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.935847  hitchhiker  0.000848946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6284  putative lipoprotein  25 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16840  hypothetical protein  27.7 
 
 		 266 aa  43.5  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72400  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family protein  25 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0488  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase/peptidoglycan binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.023977  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1701  anhydro-N-acetylmuramyl-tripeptide amidase  27.81 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.873763  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  33.77 
 
 		 546 aa  42.7  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1659  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.86 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0338  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 2  24.48 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  25.93 
 
 		 539 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>