82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0545 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0545  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 		 157 aa  325  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0529  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase, putative  98.73 
 
 		 222 aa  324  3e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.549299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3666  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  40.4 
 
 		 150 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1572  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.22 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.577314  normal  0.236623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.22 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3670  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.27 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0492519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3323  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  39.07 
 
 		 150 aa  97.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3745  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.86 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.58 
 
 		 150 aa  94.4  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3698  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.58 
 
 		 150 aa  94.4  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3389  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.58 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0561834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3648  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.58 
 
 		 150 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3340  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.58 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1669  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.08 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.761458  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4129  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.76 
 
 		 406 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2269  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  34.81 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0638229  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1925  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase  34.31 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0536095  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1862  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  32.91 
 
 		 219 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.108984 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.89 
 
 		 542 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1929  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  32.14 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  32 
 
 		 391 aa  67.8  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3764  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  34.93 
 
 		 288 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0204504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4840  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.1 
 
 		 277 aa  64.7  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1023  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.45 
 
 		 636 aa  64.7  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2719  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.5 
 
 		 274 aa  64.3  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3775  negative regulator of AmpC, AmpD  35.14 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  27.01 
 
 		 370 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.21 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1972  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.61 
 
 		 220 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.289767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.74 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0417  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.7 
 
 		 905 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.57 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2393  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.56 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.17 
 
 		 694 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.77 
 
 		 375 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.33 
 
 		 964 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2038  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  34.44 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000469429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5274  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  29.29 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35340  negative regulator of beta-lactamase expression  30.07 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34600  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.43 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.123006  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0009  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.12 
 
 		 684 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0099  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.27 
 
 		 552 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  28.19 
 
 		 539 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1539  twin-arginine translocation pathway signal  34.31 
 
 		 486 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.407284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  25 
 
 		 695 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2561  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.4 
 
 		 784 aa  54.3  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.32 
 
 		 964 aa  53.9  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  22.52 
 
 		 879 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2558  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.78 
 
 		 728 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  24.19 
 
 		 654 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  26.42 
 
 		 366 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0021339  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.46 
 
 		 950 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0455  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.64 
 
 		 357 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2707  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.74 
 
 		 184 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000658239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0427  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  29.85 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.531523  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16840  hypothetical protein  29.79 
 
 		 266 aa  50.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0270  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.56 
 
 		 364 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.5 
 
 		 356 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.61 
 
 		 1072 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  25.15 
 
 		 541 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1789  negative regulator of AmpC, AmpD  27.43 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.15 
 
 		 959 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  25.5 
 
 		 537 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  25.5 
 
 		 537 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  25.5 
 
 		 537 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  27 
 
 		 928 aa  47.4  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3789  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.56 
 
 		 591 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3188  animal peptidoglycan recognition protein PGRP  27.1 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000281584  normal  0.0104893 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01632  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  24.46 
 
 		 315 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0771  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  27.12 
 
 		 229 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4072  hypothetical protein  32.14 
 
 		 267 aa  44.3  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  23.21 
 
 		 539 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5070  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  23.6 
 
 		 353 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4944  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.06 
 
 		 301 aa  43.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.038406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2544  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  24.67 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000466767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0034  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.89 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0196  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  26.67 
 
 		 502 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0282  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  26.67 
 
 		 136 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.567186  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0316  hypothetical protein  29.41 
 
 		 218 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0335  hypothetical protein  29.41 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 907 aa  41.2  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  25.4 
 
 		 794 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>