276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3522 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3522  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  100 
 
 
276 aa  566  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  35.35 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  30 
 
 
270 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  30.2 
 
 
271 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  32.6 
 
 
271 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  27.72 
 
 
272 aa  102  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  32.67 
 
 
272 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  32.5 
 
 
272 aa  99.4  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  29.58 
 
 
272 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  29.58 
 
 
272 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  24.79 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  29.41 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  30.66 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  29.95 
 
 
290 aa  96.3  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  26.24 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.88 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  31.28 
 
 
303 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  29.41 
 
 
272 aa  94  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  33.51 
 
 
585 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  28.73 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  29.78 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  26.19 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  31.63 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  32.5 
 
 
276 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  28.79 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  28.75 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  28.51 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  29 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3818  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.27 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.389852 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  25.53 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2048  hypothetical protein  28.26 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  27.17 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0795  phosphate binding protein  28.25 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.782994  hitchhiker  0.00638509 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  26.56 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  26.27 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  22.85 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1053  phosphate binding protein  25.09 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216116  hitchhiker  0.000268052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1024  phosphate binding protein  25.09 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  28.2 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  28.22 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3997  phosphate binding protein  31.34 
 
 
651 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  27.18 
 
 
562 aa  75.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0897  phosphate binding protein  26.28 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.52512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  25.47 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.1 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  25.26 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  25.35 
 
 
460 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  26.12 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.53 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  28.83 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  30.43 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4582  phosphate binding protein  29.18 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246324  normal  0.457545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  26.42 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  24.44 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  27.78 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0960  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.45 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  26.61 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  25.19 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.34 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  25.81 
 
 
558 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4492  phosphate binding protein  28.29 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.12 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  25.09 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  27.75 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  24.62 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1099  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.3 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  25.19 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  24.35 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  26.1 
 
 
435 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  25.12 
 
 
482 aa  68.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  28.23 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  25.68 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  25 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2445  phosphate binding protein  24.8 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605633 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  25 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25.84 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  25.69 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  27.56 
 
 
692 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  29.1 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  28.12 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1654  phosphate binding protein  26.89 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  27.94 
 
 
558 aa  66.6  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1350  putative periplasmic phosphate-binding protein  24.55 
 
 
498 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  27.61 
 
 
451 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  28.8 
 
 
435 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  27.98 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3562  phosphate binding protein  26.62 
 
 
333 aa  65.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.581746  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4410  phosphate binding protein  23.08 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0765558  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2803  phosphate binding protein  24.81 
 
 
341 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.913176 
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.25 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  25.12 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4157  phosphate binding protein  27.54 
 
 
666 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.16838  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1402  hypothetical protein  26.46 
 
 
388 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.728708 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  27.27 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  22.22 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4125  phosphate binding protein  24.19 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  27.4 
 
 
428 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4405  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.79 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>