More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1955 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1955  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 421 aa  865    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0948172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3441  NADH dehydrogenase I, F subunit  58.75 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0157  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  58.75 
 
 		 422 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0329  NADH dehydrogenase (quinone)  56.46 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0176  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  55.53 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0158  NADH dehydrogenase (quinone)  55.53 
 
 		 421 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.19 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.12 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0208  NADH dehydrogenase I chain F  51.91 
 
 		 425 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.71 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  52.05 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.39 
 
 		 454 aa  418  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.19 
 
 		 421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1116  NADH dehydrogenase (quinone)  51.23 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  45.24 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  45.24 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  45.24 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  45 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2768  NADH dehydrogenase I subunit F  45.43 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  45.24 
 
 		 445 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  45.24 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2670  NADH dehydrogenase I subunit F  45.24 
 
 		 445 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.793863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  45.19 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  45.24 
 
 		 445 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  45.24 
 
 		 445 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  45.24 
 
 		 445 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  45.24 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02209  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F  45.24 
 
 		 445 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.24 
 
 		 445 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  45.24 
 
 		 445 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  45.24 
 
 		 445 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4067  NADH dehydrogenase (quinone)  47.49 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0902793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  44.76 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  44.76 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  44.76 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  45.17 
 
 		 445 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0714  NADH dehydrogenase (quinone)  50.62 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0588  NADH dehydrogenase I, F subunit  46.04 
 
 		 474 aa  368  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0577  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.8 
 
 		 474 aa  364  1e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.71 
 
 		 433 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  43.78 
 
 		 545 aa  364  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.47 
 
 		 441 aa  362  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0377  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.23 
 
 		 444 aa  362  7.0000000000000005e-99  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.372414  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  43.53 
 
 		 545 aa  362  8e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1695  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.19 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.316564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  43.3 
 
 		 545 aa  360  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2546  NADH dehydrogenase I subunit F  46.88 
 
 		 449 aa  359  6e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698943  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.15 
 
 		 434 aa  359  6e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.25 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1869  NADH dehydrogenase I subunit F  43.72 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.123144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1398  NADH dehydrogenase I subunit F  46.15 
 
 		 449 aa  356  5e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.940574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2416  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.37 
 
 		 448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0718255  normal  0.148536 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  43.46 
 
 		 602 aa  353  4e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 		 597 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4123  NADH dehydrogenase I subunit F  43.24 
 
 		 453 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1742  NADH dehydrogenase I subunit F  43.24 
 
 		 453 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00767478  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1017  NADH dehydrogenase I subunit F  44.31 
 
 		 461 aa  351  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2566  NADH dehydrogenase I subunit F  43.27 
 
 		 448 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.01 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.01 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.01 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3695  NADH dehydrogenase I subunit F  43 
 
 		 454 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3128  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.56 
 
 		 446 aa  349  5e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.72 
 
 		 451 aa  349  6e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.57 
 
 		 425 aa  349  7e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.79 
 
 		 441 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.99 
 
 		 427 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.99 
 
 		 427 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  43.36 
 
 		 607 aa  347  2e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  43.36 
 
 		 607 aa  347  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.05 
 
 		 706 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28480  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.58 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  42.14 
 
 		 539 aa  347  3e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  43.3 
 
 		 436 aa  346  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.23 
 
 		 448 aa  346  4e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  41.44 
 
 		 614 aa  345  6e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.48 
 
 		 449 aa  345  6e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.27 
 
 		 422 aa  345  7e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  44.6 
 
 		 428 aa  345  7e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3201  NADH dehydrogenase I subunit F  42.75 
 
 		 452 aa  345  8e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103684  normal  0.0135586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3369  NADH dehydrogenase I, F subunit  43 
 
 		 452 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  43.78 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.75 
 
 		 440 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3607  NADH dehydrogenase I subunit F  43.24 
 
 		 451 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.79 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.06 
 
 		 443 aa  342  9e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  42.92 
 
 		 426 aa  341  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0104  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  45.17 
 
 		 416 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1740  NADH dehydrogenase (quinone)  44.93 
 
 		 416 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  39.95 
 
 		 610 aa  338  9.999999999999999e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0429  NADH dehydrogenase (quinone)  42.57 
 
 		 624 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  44.83 
 
 		 445 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.78 
 
 		 456 aa  336  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  43.54 
 
 		 428 aa  336  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1604  NADP-reducing hydrogenase chain C  39.7 
 
 		 486 aa  336  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.31 
 
 		 438 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1693  NADH dehydrogenase (quinone)  44.93 
 
 		 416 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0681624  normal  0.883791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  44 
 
 		 424 aa  335  7.999999999999999e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  42.29 
 
 		 623 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  41.59 
 
 		 446 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>