30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1400 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  50 
 
 		 242 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  43.37 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  46.67 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  44.49 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  44.68 
 
 		 241 aa  198  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  43.6 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  43.36 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  43.36 
 
 		 280 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  43.97 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  43.78 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  42.98 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  42.21 
 
 		 267 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  44.59 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  41.53 
 
 		 271 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  41.67 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  42.5 
 
 		 263 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  40 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  26.34 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  25.61 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2276  hypothetical protein  28.75 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3495  hypothetical protein  27.33 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.84074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  24.1 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2262  hypothetical protein  25.41 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  23.12 
 
 		 234 aa  45.4  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1973  hypothetical protein  25.41 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0572365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3017  hypothetical protein  22.89 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0496127  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4779  hypothetical protein  23.21 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2433  hypothetical protein  26.71 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4328  hypothetical protein  24.4 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>