22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0340 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  50.47 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  48.94 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  46.02 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  42.91 
 
 		 280 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  43.93 
 
 		 267 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  46.7 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  42.75 
 
 		 274 aa  188  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  44.26 
 
 		 263 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  46.93 
 
 		 251 aa  185  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  45.95 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  41.09 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  42.99 
 
 		 242 aa  181  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  42.39 
 
 		 271 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  41.55 
 
 		 235 aa  170  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  39.57 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  165  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  42.11 
 
 		 241 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  29.47 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  29.01 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3520  hypothetical protein  23.81 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>