21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2403 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  584  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  44.68 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  43.37 
 
 		 234 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  44.67 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  43.15 
 
 		 242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  41.77 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  41.67 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  42.06 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  41.42 
 
 		 271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  42.69 
 
 		 263 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  39.57 
 
 		 217 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  36.82 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  37.14 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  35.39 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  41.36 
 
 		 241 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  37.75 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  34.63 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  35.34 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  28.7 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  34.33 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2262  hypothetical protein  28.32 
 
 		 229 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>