23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0578 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  496  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  48.48 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  44.68 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  43.5 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  44.05 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  44.65 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  42.41 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  41.18 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  42.13 
 
 		 263 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  44.04 
 
 		 235 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  39.75 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  38.24 
 
 		 274 aa  177  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  37.59 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  39.92 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  37.93 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  37.59 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  41.35 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  39.92 
 
 		 283 aa  165  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  31.12 
 
 		 264 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1973  hypothetical protein  27.51 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0572365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2262  hypothetical protein  27.49 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  25.61 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3520  hypothetical protein  23.86 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>