32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2668 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  50 
 
 		 234 aa  224  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  48.2 
 
 		 245 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  48.48 
 
 		 241 aa  211  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  45.08 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  42.97 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  43.25 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  45.71 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  43.57 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  41.54 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  42.62 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  44.21 
 
 		 235 aa  194  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  41.2 
 
 		 274 aa  194  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  41.78 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  40.23 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  46.35 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  40.23 
 
 		 280 aa  187  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  42.99 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  32.5 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2276  hypothetical protein  28.25 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  25.12 
 
 		 229 aa  48.9  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3495  hypothetical protein  27.15 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.84074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  23.63 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  26.74 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1173  SAM-dependent methyltransferase  26.4 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0722958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2433  hypothetical protein  27.8 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2262  hypothetical protein  25.15 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4328  hypothetical protein  25.11 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1228  hypothetical protein  24.85 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1973  hypothetical protein  25.15 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0572365  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1134  protein of unknown function DUF633  25.32 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000709417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2390  hypothetical protein  23.31 
 
 		 231 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.351246  hitchhiker  0.000408238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>