21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1932 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  88.93 
 
 		 280 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  87.5 
 
 		 280 aa  497  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  66.18 
 
 		 251 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  52.43 
 
 		 267 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  54.71 
 
 		 255 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  52.46 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  51.71 
 
 		 271 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  50 
 
 		 245 aa  265  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  47.41 
 
 		 239 aa  221  9e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  47.2 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  43.6 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  41.2 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  42.75 
 
 		 217 aa  188  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  40.74 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  40.8 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  36.82 
 
 		 283 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  38.43 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  29.07 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  20.88 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  25.58 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>