25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1916 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  58.78 
 
 		 255 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  56.81 
 
 		 267 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  56.52 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  55.56 
 
 		 271 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  54.69 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  50.18 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  50 
 
 		 274 aa  265  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  48.75 
 
 		 280 aa  255  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  48.57 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  49.32 
 
 		 239 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  42.62 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  44.4 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  42.98 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  45.95 
 
 		 217 aa  185  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  42.45 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  40.64 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  37.14 
 
 		 283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  27.71 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  23.86 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  25.42 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1173  SAM-dependent methyltransferase  28.43 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0722958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  24.76 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1973  hypothetical protein  25.56 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0572365  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0357  hypothetical protein  27.88 
 
 		 221 aa  42  0.01  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.298514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>