20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1557 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  545  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  31.28 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  33.05 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  28.7 
 
 		 283 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  29.47 
 
 		 217 aa  87  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  32 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  29.07 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  28.57 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  28.84 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  29.29 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  28.12 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  31.03 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  29.66 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  27.52 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  26.77 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  26.34 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  27.71 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  27.76 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3520  hypothetical protein  19.23 
 
 		 251 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>