22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1357 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  51.85 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  50.39 
 
 		 255 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  48.3 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  47.21 
 
 		 271 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  48.47 
 
 		 263 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  53.07 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  46.69 
 
 		 280 aa  221  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  47.41 
 
 		 274 aa  221  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  49.32 
 
 		 245 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  46.89 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  46.41 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  45.91 
 
 		 280 aa  210  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  48.94 
 
 		 217 aa  204  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  45.08 
 
 		 242 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  41.77 
 
 		 283 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  41.67 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  41 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  27.27 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  25.13 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  23.86 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  21.97 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>