62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0645 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  461  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3035  protein of unknown function DUF633  35.86 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143624  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0625  hypothetical protein  40.31 
 
 
240 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.155945  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2411  protein of unknown function DUF633  34.21 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00449661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0160  protein of unknown function DUF633  35.81 
 
 
234 aa  128  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2460  hypothetical protein  34.82 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  34.15 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0496  hypothetical protein  36.14 
 
 
231 aa  121  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000915457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1975  protein of unknown function DUF633  37.43 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0746  hypothetical protein  29.73 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0829  hypothetical protein  31.62 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000387788  hitchhiker  1.2637100000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4424  hypothetical protein  35.39 
 
 
235 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4370  hypothetical protein  35.39 
 
 
235 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00679884  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1111  SAM-dependent methyltransferase  28.63 
 
 
237 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0101071  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4513  hypothetical protein  34.83 
 
 
235 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000472419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4407  hypothetical protein  35.03 
 
 
235 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4040  hypothetical protein  34.83 
 
 
235 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000619844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4030  hypothetical protein  34.83 
 
 
235 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000059354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4192  hypothetical protein  34.83 
 
 
235 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00200706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4312  hypothetical protein  34.83 
 
 
235 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95415e-51 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1973  hypothetical protein  31.96 
 
 
229 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0572365  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1228  hypothetical protein  31.9 
 
 
228 aa  106  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1126  hypothetical protein  29 
 
 
229 aa  105  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000295652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4142  hypothetical protein  34.83 
 
 
235 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000128061  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1203  hypothetical protein  30.17 
 
 
227 aa  104  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2433  hypothetical protein  33.52 
 
 
251 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850819  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2262  hypothetical protein  31.44 
 
 
229 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0543  protein of unknown function DUF633  28.14 
 
 
231 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1173  SAM-dependent methyltransferase  34.66 
 
 
229 aa  101  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0722958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3520  hypothetical protein  34.19 
 
 
251 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2868  hypothetical protein  28.63 
 
 
231 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.505053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2276  hypothetical protein  27.07 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699979  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3017  hypothetical protein  33.15 
 
 
235 aa  99  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0496127  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3495  hypothetical protein  27.07 
 
 
230 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.84074  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1620  protein of unknown function DUF633  31.82 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.282895  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0770  SAM-dependent methyltransferase  26.99 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1652  hypothetical protein  36.31 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1618  hypothetical protein  36.31 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0130761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0893  hypothetical protein  32.68 
 
 
234 aa  91.7  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000579541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4215  protein of unknown function DUF633  26.59 
 
 
265 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866297  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2390  hypothetical protein  32.22 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.351246  hitchhiker  0.000408238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4779  hypothetical protein  33.15 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  31.28 
 
 
231 aa  88.2  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4328  hypothetical protein  30.94 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1216  protein of unknown function DUF633  27.23 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079225  hitchhiker  0.00246839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0102  hypothetical protein  35.87 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1134  protein of unknown function DUF633  27.81 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000709417  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0009  hypothetical protein  32.45 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.400013  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0357  hypothetical protein  26.85 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.298514  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0502  hypothetical protein  25.71 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00991935  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  24.23 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  25.12 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl271  putative SAM-dependent methyltransferase  21.29 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0014027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  24.56 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  24.1 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  24.76 
 
 
245 aa  45.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  21.97 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  25.28 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  25.2 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  31.33 
 
 
267 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  25.58 
 
 
274 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  22.57 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>