23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2328 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2328  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2444  hypothetical protein  93.54 
 
 
263 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2328  hypothetical protein  92.51 
 
 
267 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2018  hypothetical protein  90.41 
 
 
271 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00140757  hitchhiker  0.00602396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1916  hypothetical protein  58.78 
 
 
245 aa  294  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2449  hypothetical protein  60.71 
 
 
251 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1932  hypothetical protein  54.71 
 
 
274 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2101  hypothetical protein  54.68 
 
 
280 aa  278  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.102691  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1877  hypothetical protein  55.04 
 
 
280 aa  278  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.591711  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2945  hypothetical protein  53.85 
 
 
245 aa  242  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1357  hypothetical protein  50.39 
 
 
239 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  45.08 
 
 
242 aa  208  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  48.36 
 
 
235 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2722  hypothetical protein  45.2 
 
 
235 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0155766  hitchhiker  0.000528217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  43.97 
 
 
234 aa  195  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0340  hypothetical protein  46.7 
 
 
217 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0562312  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2403  hypothetical protein  42.06 
 
 
283 aa  191  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0578  hypothetical protein  43.06 
 
 
241 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1557  hypothetical protein  29.66 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.275394  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  26.92 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  25.41 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0357  hypothetical protein  26.55 
 
 
221 aa  47  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.298514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  22.57 
 
 
229 aa  42.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>